157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0290 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_0290  heat shock protein DnaJ-like  100 
 
 
215 aa  450  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0539  heat shock protein DnaJ-like  96.74 
 
 
215 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0501  heat shock protein DnaJ domain protein  85.12 
 
 
214 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0536  heat shock protein DnaJ-like  76.85 
 
 
219 aa  349  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.957898  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0496  heat shock protein DnaJ-like  72.22 
 
 
218 aa  324  7e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0401  heat shock protein DnaJ  69.59 
 
 
232 aa  305  3e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7569  hypothetical protein  73.68 
 
 
189 aa  277  9e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6741  heat shock protein DnaJ domain protein  48.8 
 
 
206 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.450811  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3428  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.89 
 
 
206 aa  175  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6495  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.97 
 
 
206 aa  174  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  decreased coverage  0.00341928 
 
 
-
 
NC_004310  BR2024  DnaJ domain-containing protein  43.58 
 
 
209 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0763655  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1947  DnaJ domain-containing protein  43.58 
 
 
209 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.673449  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3697  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.64 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700158 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0319  heat shock protein DnaJ domain protein  46.63 
 
 
199 aa  171  9e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0913  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.58 
 
 
209 aa  170  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3068  heat shock protein DnaJ-like  43.46 
 
 
206 aa  169  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2561  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.18 
 
 
211 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.747799 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3885  heat shock protein DnaJ domain protein  44.44 
 
 
205 aa  168  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3592  heat shock protein DnaJ domain protein  42.79 
 
 
205 aa  167  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.329646  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4048  molecular chaperone DnaJ family  42.66 
 
 
223 aa  165  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292979  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3555  heat shock protein DnaJ domain protein  41.88 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596429  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3231  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.88 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3426  heat shock protein DnaJ domain protein  41.84 
 
 
237 aa  160  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0081  DnaJ domain-containing protein  38.64 
 
 
206 aa  158  7e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.23 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884874  normal  0.323014 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2278  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.65 
 
 
204 aa  132  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52692  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0205  heat shock protein DnaJ-like  37.7 
 
 
203 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1876  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  51.82 
 
 
134 aa  122  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1713  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.16 
 
 
187 aa  121  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.68 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107685  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0117  heat shock protein DnaJ domain protein  37.71 
 
 
176 aa  118  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233042  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5215  heat shock protein DnaJ domain protein  37.32 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.134163 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5127  molecular chaperone DnaJ family  37.08 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1861  heat shock protein DnaJ-like  39.01 
 
 
210 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.921437  normal  0.0227918 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1874  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.75 
 
 
208 aa  106  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535727  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3077  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.64 
 
 
211 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6075  heat shock protein DnaJ domain protein  34.29 
 
 
202 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6015  heat shock protein DnaJ domain protein  35.29 
 
 
201 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2332  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.76 
 
 
200 aa  105  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0679914  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1978  DnaJ family molecular chaperone  35.2 
 
 
211 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0688  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.2 
 
 
211 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0645  heat shock protein DnaJ-like  34.22 
 
 
208 aa  102  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147986  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2910  heat shock protein DnaJ-like  34.78 
 
 
196 aa  99.4  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294745  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1202  heat shock protein DnaJ domain protein  33.52 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.370648  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0646  heat shock protein DnaJ-like protein  33.87 
 
 
176 aa  91.3  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607248  normal  0.0426843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1748  heat shock protein DnaJ-like protein  28.12 
 
 
181 aa  63.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.405714  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2948  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.41 
 
 
176 aa  62.4  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133197  normal  0.0175295 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1019  heat shock protein DnaJ-like  48.98 
 
 
177 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  43.64 
 
 
387 aa  53.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1304  heat shock protein DnaJ-like  39.62 
 
 
207 aa  52  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2957  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.62 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  42 
 
 
307 aa  48.5  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1520  heat shock protein DnaJ domain protein  38.46 
 
 
228 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  38.18 
 
 
404 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
372 aa  47.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5358  predicted protein  41.82 
 
 
294 aa  47.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653012  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  44.9 
 
 
324 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  42.59 
 
 
385 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  38.6 
 
 
385 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1630  silent information regulator protein Sir2  45.31 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  38.78 
 
 
294 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1829  heat shock protein DnaJ-like  43.14 
 
 
318 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0506  heat shock protein DnaJ-like  41.18 
 
 
330 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366766  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  40 
 
 
373 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5925  heat shock protein DnaJ domain protein  36.21 
 
 
279 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
380 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  38.78 
 
 
294 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5469  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
387 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  39.29 
 
 
386 aa  47.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0971  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
359 aa  46.6  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0083  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
374 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  40.82 
 
 
311 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  42.86 
 
 
315 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4013  chaperone DnaJ-like  35.09 
 
 
333 aa  45.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.183455  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  39.29 
 
 
297 aa  45.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
381 aa  45.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  35.71 
 
 
380 aa  45.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  39.29 
 
 
297 aa  45.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1088  heat shock protein DnaJ-like  51.35 
 
 
258 aa  45.4  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  35.71 
 
 
382 aa  45.4  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
388 aa  45.4  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0800  chaperone protein DnaJ  38 
 
 
378 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0527  chaperone protein DnaJ  36.67 
 
 
396 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0569  chaperone DnaJ domain protein  37.25 
 
 
318 aa  45.1  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0390561 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06170  DnaJ domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08300)  36.54 
 
 
418 aa  44.3  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.281227 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  34.55 
 
 
318 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1208  heat shock protein DnaJ domain protein  34 
 
 
134 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3220  chaperone protein DnaJ  33.33 
 
 
374 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000114884  hitchhiker  0.0000204508 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 
386 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2209  chaperone DnaJ domain protein  36 
 
 
374 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.990749  hitchhiker  0.0052734 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  36.36 
 
 
383 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0629  chaperone protein DnaJ  35.71 
 
 
393 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  35.71 
 
 
373 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0012  heat shock protein DnaJ domain protein  40.68 
 
 
189 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155448 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03871  DnaJ3 protein  35.19 
 
 
319 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.148184 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  40.35 
 
 
373 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  40 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  40 
 
 
287 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  34.55 
 
 
318 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  34.55 
 
 
318 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>