More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2308 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2308  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 286 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2971  dimethyladenosine transferase  84.56 
 
 		 287 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379865  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2345  dimethyladenosine transferase  83.63 
 
 		 287 aa  474  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2475  dimethyladenosine transferase  84.62 
 
 		 287 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3826  dimethyladenosine transferase  82.92 
 
 		 286 aa  464  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3476  dimethyladenosine transferase  81.75 
 
 		 287 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1682  dimethyladenosine transferase  83.21 
 
 		 287 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2833  dimethyladenosine transferase  67.02 
 
 		 288 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137486  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5840  dimethyladenosine transferase  69.06 
 
 		 283 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5102  dimethyladenosine transferase  69.34 
 
 		 285 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3924  dimethyladenosine transferase  65.11 
 
 		 291 aa  350  1e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0552  dimethyladenosine transferase  68.73 
 
 		 292 aa  349  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3639  dimethyladenosine transferase  65.47 
 
 		 296 aa  347  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  62.09 
 
 		 275 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1063  dimethyladenosine transferase  61.73 
 
 		 275 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2226  dimethyladenosine transferase  65.61 
 
 		 288 aa  338  4e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.587183 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0654  dimethyladenosine transferase  65.33 
 
 		 297 aa  338  5.9999999999999996e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3931  dimethyladenosine transferase  65.47 
 
 		 296 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2606  dimethyladenosine transferase  62.01 
 
 		 278 aa  333  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0682  dimethyladenosine transferase  63.37 
 
 		 276 aa  331  7.000000000000001e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0674  dimethyladenosine transferase  63.37 
 
 		 276 aa  331  7.000000000000001e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  62.91 
 
 		 275 aa  330  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0760  dimethyladenosine transferase  61.73 
 
 		 274 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676822  normal  0.117293 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1537  dimethyladenosine transferase  59.93 
 
 		 275 aa  327  9e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.22522  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  61.21 
 
 		 281 aa  321  9.000000000000001e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  56.83 
 
 		 280 aa  299  3e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  58.27 
 
 		 280 aa  299  4e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  58.63 
 
 		 282 aa  295  6e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0408  dimethyladenosine transferase  57.3 
 
 		 276 aa  294  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0503  dimethyladenosine transferase  54.15 
 
 		 276 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  60.3 
 
 		 288 aa  286  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  55.52 
 
 		 305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  54.68 
 
 		 278 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  55.96 
 
 		 273 aa  280  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  54.32 
 
 		 278 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  54.32 
 
 		 278 aa  278  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1478  dimethyladenosine transferase  55.15 
 
 		 271 aa  273  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2624  dimethyladenosine transferase  58.24 
 
 		 272 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  56.04 
 
 		 288 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3042  dimethyladenosine transferase  54.98 
 
 		 275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733787  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1221  dimethyladenosine transferase  51.08 
 
 		 289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675859  normal  0.381466 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  43.85 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0648  dimethyladenosine transferase  33.21 
 
 		 277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0392  dimethyladenosine transferase  33.46 
 
 		 262 aa  169  6e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00834232  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0090  dimethyladenosine transferase  36.09 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0802861  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  42.07 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  38.87 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  39.33 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  41.13 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  36.96 
 
 		 284 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  40 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  39.16 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  38.15 
 
 		 268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  38.78 
 
 		 267 aa  162  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  38.15 
 
 		 268 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  37.78 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  39.71 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  41.15 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  38.15 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  39.47 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  40.61 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  39.25 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0362  dimethyladenosine transferase  37.25 
 
 		 262 aa  160  3e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  38.02 
 
 		 267 aa  159  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  37.78 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0977  dimethyladenosine transferase  37.41 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3313  dimethyladenosine transferase  37.41 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  40.43 
 
 		 284 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  40.46 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1079  dimethyladenosine transferase  37.41 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.292406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  41.63 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1046  dimethyladenosine transferase  37.41 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  39.18 
 
 		 274 aa  156  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  37.6 
 
 		 266 aa  155  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  40.23 
 
 		 272 aa  155  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  40.08 
 
 		 267 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  39.93 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  36.26 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  41.63 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  37.1 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  39.02 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  35.58 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  35.14 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  41.25 
 
 		 262 aa  152  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6035  dimethyladenosine transferase  36.96 
 
 		 275 aa  152  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  35.25 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0678  dimethyladenosine transferase  39.62 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  37.17 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2888  dimethyladenosine transferase  36.5 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>