45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1741 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1741  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  65.09 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  61.79 
 
 		 212 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  59.43 
 
 		 212 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  61.79 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3134  hypothetical protein  44.81 
 
 		 210 aa  138  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0306  protein of unknown function DUF1109  43.87 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  33.18 
 
 		 213 aa  99.4  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  32.86 
 
 		 213 aa  96.7  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  35.21 
 
 		 212 aa  91.3  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  35.48 
 
 		 216 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  39.78 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  32.86 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  33.18 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  34.72 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  39.78 
 
 		 211 aa  85.1  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  30.88 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  38.32 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  30.37 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  36.89 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  35.48 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  33.14 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  32.62 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  33.54 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  34.86 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  40.88 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  32.86 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  31.21 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  31.61 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  35.21 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2033  putative transmembrane protein DUF1109  35.94 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  32.14 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2176  hypothetical protein  35.48 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  32.26 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  33.48 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  33.48 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  32.11 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1692  hypothetical protein  32.2 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1434  hypothetical protein  31.02 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2193  hypothetical protein  32.86 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4644  hypothetical protein  31.67 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  33.8 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2681  hypothetical protein  30 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.76812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>