176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0648 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 151 aa  297  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  68.5 
 
 		 154 aa  157  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0139  transposase IS3/IS911  77.92 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  50.81 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  53.06 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  53.06 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  53.06 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  61.25 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  49.11 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0183  IS3/IS911 family transposase  39.2 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4024  hypothetical protein  40.45 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  39.81 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1225  IS3/IS911 family transposase  38.89 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.54899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  39.81 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  45.95 
 
 		 155 aa  60.1  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  45.95 
 
 		 155 aa  60.1  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1965  transposase IS3/IS911  46.58 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1624  transposase IS3/IS911 family protein  51.67 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  39.47 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5463  transposase IS3/IS911 family protein  55.56 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  38.36 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  37.29 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  37.29 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0433  transposase IS3/IS911 family protein  44.59 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0349226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0917  transposase IS3/IS911 family protein  44.59 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.308887  normal  0.246469 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1415  transposase IS3/IS911 family protein  44.59 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1417  transposase IS3/IS911 family protein  44.59 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1807  transposase IS3/IS911 family protein  44.59 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3518  hypothetical protein  44.59 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.734603 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3717  hypothetical protein  44.59 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3720  hypothetical protein  44.59 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3761  hypothetical protein  44.59 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4303  hypothetical protein  44.59 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4310  hypothetical protein  44.59 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4167  IS3 family transposase  45.95 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827165  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2724  transposase IS3/IS911 family protein  49.15 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8231  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  45.07 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  45.07 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  45.07 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  45.07 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  45.07 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  45.07 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  43.24 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  43.24 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  43.94 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  43.94 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  43.24 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0779  hypothetical protein  48.33 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0786  transposase IS3/IS911 family protein  45.68 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  36.19 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  38.14 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  42.25 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  35.59 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6197  transposase IS3/IS911 family protein  41.1 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  35.59 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  50.98 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  50.98 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  50.98 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8376  transposase IS3/IS911 family protein  44.3 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  35.59 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3198  transposase IS3/IS911 family protein  40.7 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  45.68 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  45.68 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  37.62 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  43.75 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  46.43 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  41.98 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  37.62 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  37.62 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  37.62 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  37.62 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  37.62 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3698  hypothetical protein  40.7 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.451428 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4399  transposase IS3/IS911 family protein  40.7 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134241  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3012  transposase  48.57 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930008  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  46.43 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  37.72 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3726  hypothetical protein  34.95 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6122  transposase IS3/IS911 family protein  57.78 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6460  transposase IS3/IS911 family protein  46 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4786  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5410  transposase IS3/IS911 family protein  37.38 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.650569 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9620  hypothetical protein  46.05 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.754847  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0900  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.825197  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2730  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777363  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1804  transposase IS3/IS911 family protein  39.08 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4652  transposase IS3/IS911 family protein  37.65 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.110926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8238  transposase  42.31 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>