111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4655 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 273 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  86.08 
 
 		 273 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  76.56 
 
 		 273 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  71.81 
 
 		 267 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  72.73 
 
 		 176 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  55.08 
 
 		 277 aa  255  7e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  49.43 
 
 		 264 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  51.18 
 
 		 270 aa  234  9e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  49.21 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  47.43 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  50.2 
 
 		 287 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  46.3 
 
 		 271 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  45.02 
 
 		 257 aa  214  8e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  47.62 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  45.24 
 
 		 271 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  47.13 
 
 		 276 aa  206  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  44.18 
 
 		 272 aa  202  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  43.37 
 
 		 271 aa  198  7e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  42.91 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  42.17 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  44.84 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  44.21 
 
 		 266 aa  175  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  39.92 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  38.06 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  34.87 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  34.87 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  35.02 
 
 		 279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  32.78 
 
 		 277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  33.47 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 		 265 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 		 288 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 		 275 aa  122  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  32.33 
 
 		 390 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  33.48 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  32.33 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  33.48 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  32.33 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  32.19 
 
 		 265 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  32.19 
 
 		 265 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 285 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  30.54 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  24.37 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3690  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.557915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  30.85 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  32.32 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  23.47 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  24.32 
 
 		 387 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 		 285 aa  49.7  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  28 
 
 		 429 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  37.96 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  31.82 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  23.91 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  26.74 
 
 		 296 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  23.78 
 
 		 348 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  31.22 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2305  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 281 aa  46.6  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 348 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  24.6 
 
 		 307 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  24.22 
 
 		 299 aa  45.8  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0950  alpha/beta hydrolase fold  35.85 
 
 		 284 aa  45.8  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 339 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  30.57 
 
 		 300 aa  45.8  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1498  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 324 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  30.89 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  40.95 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  30.56 
 
 		 342 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3568  Alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0257229  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 352 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25500  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.65 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0257089  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.11 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  34.09 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  30.56 
 
 		 877 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  30.56 
 
 		 441 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  30.56 
 
 		 404 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  30.56 
 
 		 439 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  25.62 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  30.56 
 
 		 404 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  20.56 
 
 		 330 aa  43.5  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1559  alpha/beta hydrolase fold protein  26.06 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0478161  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 271 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 282 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  21.31 
 
 		 381 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  25.34 
 
 		 333 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5231  alpha/beta hydrolase fold protein  27.16 
 
 		 293 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 312 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>