64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4248 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4248  MOSC  100 
 
 		 256 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4096  hypothetical protein  75.5 
 
 		 289 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.496795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4922  MOSC domain containing protein  73.12 
 
 		 262 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1194  hypothetical protein  64.94 
 
 		 275 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.102513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0588  hypothetical protein  64.82 
 
 		 258 aa  335  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0680  hypothetical protein  65.7 
 
 		 292 aa  329  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0943778  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1750  MOSC domain-containing protein  54.4 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5382  MOSC domain containing protein  55.87 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.986245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5086  MOSC domain-containing protein  54.55 
 
 		 257 aa  270  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  54.18 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2623  MOSC domain containing protein  53.78 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  55.16 
 
 		 259 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  50.4 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5445  MOSC domain-containing protein  53.85 
 
 		 256 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1901  MOSC domain-containing protein  49 
 
 		 276 aa  240  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  47.27 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  47.01 
 
 		 264 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0438681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  46.25 
 
 		 264 aa  218  7e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6353  MOSC domain containing protein  48.21 
 
 		 258 aa  216  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  47.13 
 
 		 253 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0649  MOSC domain-containing protein  39.52 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.397227  normal  0.255318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1219  MOSC domain containing protein  40.24 
 
 		 288 aa  175  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  0.014657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7245  MOSC domain-containing protein  36.62 
 
 		 312 aa  175  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.373711  normal  0.311801 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2035  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  31.84 
 
 		 587 aa  131  9e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0495078  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  31.91 
 
 		 267 aa  130  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  33.6 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  29.55 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  31.45 
 
 		 249 aa  115  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0878  MOSC domain-containing protein  30.8 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2726  MOSC domain-containing protein  31.89 
 
 		 247 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1065  hypothetical protein  32.3 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2868  MOSC domain-containing protein  30.4 
 
 		 247 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49807  predicted protein  28.78 
 
 		 302 aa  94.7  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642974  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48037  predicted protein  28.78 
 
 		 302 aa  94.7  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0645802  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  27.1 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1152  MOSC domain containing protein  40.37 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0033  MOSC domain containing protein  28.37 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0250865  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2591  hypothetical protein  27.24 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  39.47 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0072  MOSC domain containing protein  29.03 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1110  hypothetical protein  28.76 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  hitchhiker  0.000153585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4451  MOSC domain-containing protein  36.21 
 
 		 238 aa  48.9  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3425  MOSC domain protein beta barrel domain protein  23.89 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.648201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2916  MOSC domain containing protein  33.9 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.755725  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0589  hypothetical protein  26.1 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  38.16 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0045  MOSC domain protein beta barrel domain protein  28.23 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  25.18 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5393  MOSC domain-containing protein  29.27 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5304  MOSC domain-containing protein  29.27 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4067  MOSC domain containing protein  35.16 
 
 		 326 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1112  MOSC domain-containing protein  33.33 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  30.43 
 
 		 267 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2364  hypothetical protein  31.91 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000594582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3900  Fe-S protein-like protein  28.57 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  34.62 
 
 		 268 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5683  MOSC domain-containing protein  28.46 
 
 		 274 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  36.84 
 
 		 268 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  36 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  36 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6251  MOSC domain containing protein  30.61 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.364333  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  34.67 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  34.67 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1030  MOSC domain protein beta barrel domain protein  22.01 
 
 		 262 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00321226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>