More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2766 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.95 
 
 		 479 aa  752    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.92 
 
 		 473 aa  869    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.15 
 
 		 486 aa  682    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206341  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.37 
 
 		 478 aa  744    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.84 
 
 		 487 aa  711    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  94.08 
 
 		 473 aa  917    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3894  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.36 
 
 		 471 aa  702    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287099 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.37 
 
 		 479 aa  759    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.84 
 
 		 539 aa  710    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  84.24 
 
 		 477 aa  825    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.37 
 
 		 479 aa  758    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  70 
 
 		 481 aa  695    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.98 
 
 		 482 aa  693    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.81 
 
 		 487 aa  706    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 473 aa  959    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.58 
 
 		 480 aa  743    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.74 
 
 		 472 aa  861    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  92.6 
 
 		 473 aa  908    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.13 
 
 		 481 aa  695    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  85.08 
 
 		 477 aa  814    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  72 
 
 		 480 aa  702    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.53 
 
 		 479 aa  748    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.07 
 
 		 487 aa  700    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.95 
 
 		 478 aa  743    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.87 
 
 		 481 aa  686    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1425  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.61 
 
 		 466 aa  625  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197772  hitchhiker  0.000000283985 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.6 
 
 		 463 aa  619  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.19 
 
 		 464 aa  614  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.48 
 
 		 465 aa  613  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.19 
 
 		 464 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.98 
 
 		 468 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.19 
 
 		 464 aa  609  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.1 
 
 		 465 aa  595  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2823  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.77 
 
 		 465 aa  594  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.27 
 
 		 465 aa  596  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.23 
 
 		 465 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.34 
 
 		 466 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.47 
 
 		 465 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.84 
 
 		 469 aa  561  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.850345  decreased coverage  0.00227015 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.89 
 
 		 470 aa  559  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.57 
 
 		 465 aa  542  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.51 
 
 		 466 aa  510  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  52.69 
 
 		 457 aa  494  9.999999999999999e-139  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.23 
 
 		 465 aa  485  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.54 
 
 		 474 aa  483  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.74 
 
 		 468 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.39 
 
 		 462 aa  478  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  53.52 
 
 		 464 aa  478  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.67 
 
 		 465 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2779  dihydrolipoamide dehydrogenase E3 component of 3 enzyme complexes  50.43 
 
 		 463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.285583  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.03 
 
 		 462 aa  470  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.92 
 
 		 462 aa  466  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.96 
 
 		 466 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.43 
 
 		 468 aa  458  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.33 
 
 		 468 aa  449  1e-125  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0853  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.32 
 
 		 465 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50611  normal  0.0780472 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.58 
 
 		 491 aa  441  9.999999999999999e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.67 
 
 		 470 aa  420  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0435  hypothetical protein  49.12 
 
 		 478 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0273668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.8 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0463  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.22 
 
 		 457 aa  408  1e-113  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.55 
 
 		 468 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.1 
 
 		 465 aa  401  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.49 
 
 		 471 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.81 
 
 		 474 aa  392  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.13 
 
 		 464 aa  391  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.53 
 
 		 464 aa  391  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.53 
 
 		 461 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2479  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.49 
 
 		 467 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.58 
 
 		 467 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.55 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0616  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.86 
 
 		 466 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.55 
 
 		 473 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3518  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.92 
 
 		 464 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.65 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.19 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.45 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.17 
 
 		 463 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.96 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5475  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.32 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67474  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.96 
 
 		 476 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.39 
 
 		 476 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.96 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.96 
 
 		 581 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.87 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.07 
 
 		 464 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.07 
 
 		 476 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.13 
 
 		 462 aa  366  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.43 
 
 		 473 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.75 
 
 		 476 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0784  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.06 
 
 		 472 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.04 
 
 		 465 aa  365  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.75 
 
 		 476 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.75 
 
 		 476 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.75 
 
 		 476 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.57 
 
 		 476 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.57 
 
 		 476 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0631  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.58 
 
 		 466 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0644  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.58 
 
 		 466 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0624  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.34 
 
 		 466 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  0.337004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>