44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3054 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 311 aa  648    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3188  choline/ethanolamine kinase  94.21 
 
 		 311 aa  617  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  65.06 
 
 		 313 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  54.37 
 
 		 311 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  54.37 
 
 		 311 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  54.05 
 
 		 311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  53.07 
 
 		 311 aa  338  8e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  53.27 
 
 		 307 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  47.9 
 
 		 314 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  47.9 
 
 		 314 aa  292  5e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  27.87 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  27.82 
 
 		 622 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 622 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  29.93 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  22.9 
 
 		 383 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0105  aminoglycoside phosphotransferase  28.3 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0176137 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7266  aminoglycoside phosphotransferase  21.63 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105045  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3189  hypothetical protein  26.71 
 
 		 317 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  21.91 
 
 		 383 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  25.36 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2596  hypothetical protein  24.61 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3055  aminoglycoside phosphotransferase  24.72 
 
 		 317 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214453  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1456  hypothetical protein  27.17 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3751  aminoglycoside phosphotransferase  26.36 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4046  aminoglycoside phosphotransferase  25.77 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.411074  normal  0.268471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4006  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  24.35 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  24.32 
 
 		 611 aa  69.7  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0044  aminoglycoside phosphotransferase  27.91 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  22.58 
 
 		 589 aa  59.3  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42574  predicted protein  24.35 
 
 		 421 aa  59.3  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.202848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  25.96 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  21.82 
 
 		 522 aa  57.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  25.09 
 
 		 619 aa  55.8  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  25.52 
 
 		 291 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59919  ethanolamine kinase  18.51 
 
 		 526 aa  50.1  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.671475  normal  0.729563 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  23.84 
 
 		 596 aa  49.7  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  18.84 
 
 		 267 aa  47  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10156  ethanolamine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11550)  19.25 
 
 		 413 aa  46.2  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.348276  normal  0.68664 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  20.74 
 
 		 595 aa  46.2  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  24.6 
 
 		 592 aa  45.4  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003999  hypothetical protein  23.61 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  24.04 
 
 		 590 aa  44.3  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46453  predicted protein  25.69 
 
 		 438 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>