More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1445 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1445  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  352  2e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0017  IS30 family transposase  79.84 
 
 		 272 aa  199  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.701349  hitchhiker  0.00772607 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1687  IS30 family transposase  79.84 
 
 		 272 aa  199  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0638598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1165  integrase catalytic subunit  78.23 
 
 		 272 aa  196  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1495  integrase catalytic subunit  78.23 
 
 		 272 aa  196  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.988108  normal  0.543791 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1230  integrase catalytic subunit  78.23 
 
 		 272 aa  196  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460444 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0631  integrase catalytic subunit  77.97 
 
 		 272 aa  188  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.417542  normal  0.185769 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0599  IS30 family transposase  74.58 
 
 		 292 aa  180  8.000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0645  IS30 family transposase  70.34 
 
 		 300 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.358598  normal  0.401127 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0926  IS30 family transposase  68.64 
 
 		 118 aa  168  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152565 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1120  integrase catalytic subunit  61.02 
 
 		 284 aa  145  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0731  integrase catalytic subunit  61.02 
 
 		 284 aa  145  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.100278  decreased coverage  0.000000433601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1028  integrase catalytic subunit  61.02 
 
 		 284 aa  145  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775486 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1024  integrase catalytic subunit  61.02 
 
 		 284 aa  145  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659749 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1476  integrase catalytic subunit  61.02 
 
 		 284 aa  145  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.725105  normal  0.179126 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1053  integrase catalytic subunit  61.02 
 
 		 284 aa  145  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1356  integrase catalytic subunit  61.02 
 
 		 284 aa  145  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278768 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1315  integrase catalytic subunit  61.02 
 
 		 284 aa  145  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1470  hypothetical protein  71.88 
 
 		 99 aa  137  7.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.270549  normal  0.121864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  39.83 
 
 		 275 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  34.75 
 
 		 379 aa  89  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  34.75 
 
 		 294 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1312  ISSd1, transposase orfB  34.75 
 
 		 272 aa  88.2  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04149  IS600 ORF2-like protein  34.75 
 
 		 272 aa  87.8  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0735  integrase catalytic region  34.75 
 
 		 272 aa  87.8  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0021  ISSd1, transposase orfB  34.75 
 
 		 272 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3409  integrase catalytic region  34.75 
 
 		 272 aa  87  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1713  ISSd1, transposase orfB  33.9 
 
 		 272 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2078  ISSd1, transposase orfB  33.9 
 
 		 272 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1660  ISSd1, transposase orfB  33.9 
 
 		 272 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0999  ISSd1, transposase orfB  33.9 
 
 		 272 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00251682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2035  ISSd1, transposase orfB  33.9 
 
 		 272 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1278  ISSd1, transposase orfB  33.9 
 
 		 272 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3958  ISSd1, transposase orfB  33.9 
 
 		 272 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2939  ISSd1, transposase orfB  33.9 
 
 		 272 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4403  ISSd1, transposase orfB  33.9 
 
 		 272 aa  86.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4657  ISSd1, transposase orfB  33.9 
 
 		 272 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.326182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4367  ISSd1, transposase orfB  33.9 
 
 		 272 aa  86.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0897  ISSd1, transposase orfB  33.9 
 
 		 272 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0242  ISSd1, transposase orfB  33.9 
 
 		 272 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.711406  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1008  ISSd1, transposase orfB  33.9 
 
 		 272 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.660262  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2144  ISSd1, transposase orfB  33.9 
 
 		 272 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2182  ISSd1, transposase orfB  33.9 
 
 		 272 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0788896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2191  ISSd1, transposase orfB  33.9 
 
 		 272 aa  86.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000560524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0902  ISSd1, transposase orfB  33.9 
 
 		 272 aa  86.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1599  ISSd1, transposase orfB  33.9 
 
 		 272 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000676814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0263  ISSd1, transposase orfB  33.9 
 
 		 272 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1364  ISSd1, transposase orfB  33.9 
 
 		 272 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2040  ISSd1, transposase orfB  33.9 
 
 		 272 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1358  integrase catalytic subunit  70.37 
 
 		 208 aa  85.1  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278768 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2112  ISSd1, transposase orfB  33.9 
 
 		 272 aa  85.1  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  37.5 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  37.5 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  37.5 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  37.5 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  37.5 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0138  IS3 family element, transposase orfB  35.59 
 
 		 272 aa  81.6  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  33.9 
 
 		 274 aa  80.5  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  33.9 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  35.83 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  35.83 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2765  integrase catalytic subunit  35.83 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189225  normal  0.0315769 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  36.44 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4525  integrase catalytic subunit  35.83 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4683  integrase catalytic subunit  35.83 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4709  integrase catalytic subunit  35.83 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0652  integrase catalytic subunit  36.97 
 
 		 260 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00967506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1991  integrase catalytic subunit  36.97 
 
 		 260 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752349 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1980  integrase catalytic subunit  36.97 
 
 		 269 aa  78.2  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.340546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  36.97 
 
 		 289 aa  77.8  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  36.97 
 
 		 289 aa  77.8  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2526  integrase catalytic subunit  35 
 
 		 282 aa  77.4  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  37.9 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  36.97 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  35 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  35 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  35 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2475  integrase catalytic subunit  32.59 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0180519  normal  0.0292129 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  36.36 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  36.36 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  36.36 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  36.36 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  36.36 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  36.36 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  36.36 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  35 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  35 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  36.09 
 
 		 278 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4361  hypothetical protein  37.1 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  31.78 
 
 		 289 aa  74.7  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  31.78 
 
 		 289 aa  74.7  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1444  transposase IS3/IS911 family protein  33.88 
 
 		 390 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0953  transposase IS3/IS911 family protein  33.88 
 
 		 393 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3934  transposase IS3/IS911 family protein  33.88 
 
 		 390 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580476  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  31.78 
 
 		 289 aa  74.7  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3173  transposase IS3/IS911 family protein  33.88 
 
 		 390 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3581  integrase catalytic subunit  35.65 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.303631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3627  integrase catalytic subunit  35.65 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4706  integrase catalytic subunit  35.65 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  34.15 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>