More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1470 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1470  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  207  6e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.270549  normal  0.121864 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0631  integrase catalytic subunit  73.96 
 
 		 272 aa  155  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.417542  normal  0.185769 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1495  integrase catalytic subunit  77.08 
 
 		 272 aa  153  6e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.988108  normal  0.543791 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1230  integrase catalytic subunit  77.08 
 
 		 272 aa  153  6e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460444 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1165  integrase catalytic subunit  77.08 
 
 		 272 aa  153  6e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0017  IS30 family transposase  72.92 
 
 		 272 aa  150  5e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.701349  hitchhiker  0.00772607 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1687  IS30 family transposase  72.92 
 
 		 272 aa  150  5e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0638598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0599  IS30 family transposase  66.33 
 
 		 292 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0645  IS30 family transposase  67.71 
 
 		 300 aa  142  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.358598  normal  0.401127 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0926  IS30 family transposase  66.67 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152565 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1445  hypothetical protein  71.88 
 
 		 167 aa  137  6e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1120  integrase catalytic subunit  56.25 
 
 		 284 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1315  integrase catalytic subunit  56.25 
 
 		 284 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1028  integrase catalytic subunit  56.25 
 
 		 284 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775486 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0731  integrase catalytic subunit  56.25 
 
 		 284 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.100278  decreased coverage  0.000000433601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1053  integrase catalytic subunit  56.25 
 
 		 284 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1024  integrase catalytic subunit  56.25 
 
 		 284 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659749 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1476  integrase catalytic subunit  56.25 
 
 		 284 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.725105  normal  0.179126 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1356  integrase catalytic subunit  56.25 
 
 		 284 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278768 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  30.85 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  36.08 
 
 		 296 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  36.08 
 
 		 296 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  36.08 
 
 		 296 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  36.08 
 
 		 296 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  36.08 
 
 		 296 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  36.08 
 
 		 296 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  36.08 
 
 		 296 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  29.79 
 
 		 379 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  29.79 
 
 		 294 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04149  IS600 ORF2-like protein  29.79 
 
 		 272 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1312  ISSd1, transposase orfB  29.79 
 
 		 272 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0735  integrase catalytic region  29.79 
 
 		 272 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  28.72 
 
 		 274 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  28.72 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  37.36 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3409  integrase catalytic region  29.79 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0021  ISSd1, transposase orfB  29.79 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1239  integrase, catalytic region  30.85 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1713  ISSd1, transposase orfB  28.72 
 
 		 272 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2144  ISSd1, transposase orfB  28.72 
 
 		 272 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2939  ISSd1, transposase orfB  28.72 
 
 		 272 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1599  ISSd1, transposase orfB  28.72 
 
 		 272 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000676814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1278  ISSd1, transposase orfB  28.72 
 
 		 272 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3958  ISSd1, transposase orfB  28.72 
 
 		 272 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2182  ISSd1, transposase orfB  28.72 
 
 		 272 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0788896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0902  ISSd1, transposase orfB  28.72 
 
 		 272 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2078  ISSd1, transposase orfB  28.72 
 
 		 272 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0263  ISSd1, transposase orfB  28.72 
 
 		 272 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4403  ISSd1, transposase orfB  28.72 
 
 		 272 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4367  ISSd1, transposase orfB  28.72 
 
 		 272 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4657  ISSd1, transposase orfB  28.72 
 
 		 272 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.326182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2191  ISSd1, transposase orfB  28.72 
 
 		 272 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000560524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1008  ISSd1, transposase orfB  28.72 
 
 		 272 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.660262  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2035  ISSd1, transposase orfB  28.72 
 
 		 272 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0999  ISSd1, transposase orfB  28.72 
 
 		 272 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00251682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1364  ISSd1, transposase orfB  28.72 
 
 		 272 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2040  ISSd1, transposase orfB  28.72 
 
 		 272 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0897  ISSd1, transposase orfB  28.72 
 
 		 272 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0242  ISSd1, transposase orfB  28.72 
 
 		 272 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.711406  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1660  ISSd1, transposase orfB  28.72 
 
 		 272 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  33 
 
 		 291 aa  60.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  33 
 
 		 291 aa  60.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2112  ISSd1, transposase orfB  28.72 
 
 		 272 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  31.31 
 
 		 296 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  33.67 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  33.67 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2475  integrase catalytic subunit  33.67 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0180519  normal  0.0292129 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  33.67 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0185  ISMca2 transposase OrfB  32 
 
 		 291 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213513 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0070  ISMca2 transposase OrfB  32 
 
 		 291 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088066 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0571  ISMca2 transposase OrfB  32 
 
 		 291 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23921  normal  0.0300939 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0587  ISMca2 transposase OrfB  32 
 
 		 291 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761461 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0549  ISMca2 transposase OrfB  32 
 
 		 291 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151699  normal  0.0449666 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0004  ISMca2 transposase OrfB  32 
 
 		 291 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0575577 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1059  ISMca2 transposase OrfB  32 
 
 		 291 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  34.74 
 
 		 286 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4361  hypothetical protein  34.38 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  32.63 
 
 		 286 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  32.63 
 
 		 286 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  32.63 
 
 		 286 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  32.63 
 
 		 286 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  32.63 
 
 		 286 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  34.38 
 
 		 270 aa  57.4  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  34.38 
 
 		 270 aa  57.4  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  31.76 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  31.76 
 
 		 288 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  31.76 
 
 		 288 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  31.76 
 
 		 288 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  31.76 
 
 		 288 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  31.76 
 
 		 288 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  31.76 
 
 		 288 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4847  IS3, transposase orfB  31.76 
 
 		 288 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  31.76 
 
 		 288 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  31.76 
 
 		 288 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  31.76 
 
 		 288 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0458433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>