More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4361 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4361  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  371  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2765  integrase catalytic subunit  77.42 
 
 		 282 aa  210  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189225  normal  0.0315769 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4525  integrase catalytic subunit  77.42 
 
 		 282 aa  210  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4683  integrase catalytic subunit  76.61 
 
 		 282 aa  208  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4709  integrase catalytic subunit  76.61 
 
 		 282 aa  208  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2526  integrase catalytic subunit  76.61 
 
 		 282 aa  207  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  60.14 
 
 		 296 aa  180  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  60.14 
 
 		 296 aa  180  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  60.14 
 
 		 296 aa  180  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  60.14 
 
 		 296 aa  180  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  60.14 
 
 		 296 aa  180  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  60.14 
 
 		 296 aa  180  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  60.14 
 
 		 296 aa  180  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2848  integrase catalytic subunit  60.56 
 
 		 302 aa  178  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0105  integrase catalytic subunit  71.67 
 
 		 273 aa  175  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3810  integrase catalytic subunit  71.67 
 
 		 273 aa  175  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000660644 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  58.99 
 
 		 297 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  58.99 
 
 		 297 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  58.99 
 
 		 297 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  58.99 
 
 		 297 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  58.99 
 
 		 297 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  58.99 
 
 		 297 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  58.99 
 
 		 297 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  58.99 
 
 		 297 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  58.99 
 
 		 297 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  58.99 
 
 		 297 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  58.99 
 
 		 297 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  58.99 
 
 		 297 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  58.99 
 
 		 297 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.210808 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6588  integrase catalytic region  57.97 
 
 		 296 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2445  putative IS3 type transposase integrase (orfB)  57.25 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00380003  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  57.25 
 
 		 296 aa  169  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1059  ISMca2 transposase OrfB  55.56 
 
 		 291 aa  155  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0587  ISMca2 transposase OrfB  55.56 
 
 		 291 aa  155  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761461 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0571  ISMca2 transposase OrfB  55.56 
 
 		 291 aa  155  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23921  normal  0.0300939 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0549  ISMca2 transposase OrfB  55.56 
 
 		 291 aa  155  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151699  normal  0.0449666 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0185  ISMca2 transposase OrfB  55.56 
 
 		 291 aa  155  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213513 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0004  ISMca2 transposase OrfB  55.56 
 
 		 291 aa  155  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0575577 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0070  ISMca2 transposase OrfB  55.56 
 
 		 291 aa  155  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088066 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  55.64 
 
 		 289 aa  151  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  55.64 
 
 		 289 aa  151  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  55.64 
 
 		 289 aa  151  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  57.14 
 
 		 291 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  57.14 
 
 		 291 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2475  integrase catalytic subunit  53.73 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0180519  normal  0.0292129 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  53.73 
 
 		 296 aa  140  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  53.73 
 
 		 296 aa  140  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  53.73 
 
 		 296 aa  140  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  53.73 
 
 		 296 aa  140  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  48.91 
 
 		 296 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  48.91 
 
 		 296 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0673  putative integrase  46.38 
 
 		 283 aa  127  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.700911 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  45.71 
 
 		 286 aa  120  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  45.71 
 
 		 286 aa  120  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  45.71 
 
 		 286 aa  120  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  45.71 
 
 		 286 aa  120  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  45.71 
 
 		 286 aa  120  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  47.66 
 
 		 281 aa  120  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1239  integrase, catalytic region  51.28 
 
 		 122 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  40.29 
 
 		 294 aa  116  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  40.29 
 
 		 294 aa  116  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  40.29 
 
 		 294 aa  116  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  40.29 
 
 		 294 aa  116  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  40.14 
 
 		 379 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  45 
 
 		 286 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  40.29 
 
 		 294 aa  116  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  40.14 
 
 		 294 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  44.85 
 
 		 285 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3767  putative transposase  52.5 
 
 		 263 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  40.16 
 
 		 270 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  43.75 
 
 		 286 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  40.16 
 
 		 270 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  42.97 
 
 		 291 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  40.98 
 
 		 270 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  40.98 
 
 		 270 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  40.98 
 
 		 270 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  40.98 
 
 		 270 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  40.98 
 
 		 270 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  42.19 
 
 		 277 aa  108  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0138  IS3 family element, transposase orfB  44.26 
 
 		 272 aa  108  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  43.57 
 
 		 286 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04149  IS600 ORF2-like protein  41.73 
 
 		 272 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0735  integrase catalytic region  41.73 
 
 		 272 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  43.57 
 
 		 286 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  43.57 
 
 		 286 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  45.45 
 
 		 274 aa  106  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  43.57 
 
 		 286 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1312  ISSd1, transposase orfB  41.73 
 
 		 272 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  43.57 
 
 		 286 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  43.57 
 
 		 286 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  43.57 
 
 		 286 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  43.57 
 
 		 286 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  43.57 
 
 		 286 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  43.57 
 
 		 286 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  43.57 
 
 		 286 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4159  putative transposase  43.57 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  42.86 
 
 		 286 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  42.86 
 
 		 286 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  37.32 
 
 		 286 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  37.32 
 
 		 286 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>