190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0554 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0392  nucleotidyltransferase  55.28 
 
 
652 aa  729    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00832974 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0438  signal-transduction protein  53.98 
 
 
647 aa  728    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0554  signal-transduction protein  100 
 
 
681 aa  1413    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000263735 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2504  CBS domain-containing protein  32.75 
 
 
612 aa  322  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000127678 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0537  CBS domain-containing protein  31.53 
 
 
609 aa  315  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5110  signal-transduction protein  40.85 
 
 
485 aa  313  4.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0480  cyclic nucleotide-binding protein  31.09 
 
 
608 aa  307  4.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2430  signal-transduction protein  36.98 
 
 
565 aa  295  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.15974  normal  0.429408 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5960  CBS domain-containing protein  30 
 
 
617 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0450  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.75 
 
 
608 aa  291  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307047  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0466  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.85 
 
 
608 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3783  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.15 
 
 
603 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612784  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.55 
 
 
600 aa  267  5.999999999999999e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0873  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.43 
 
 
605 aa  248  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.563434  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0827  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  37.23 
 
 
601 aa  244  3e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000971693  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2831  putative nucleotidyltransferases  27.58 
 
 
610 aa  245  3e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1892  hypothetical protein  30.31 
 
 
599 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002201  predicted signal-transduction protein  33.62 
 
 
561 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1119  signal-transduction protein  33.41 
 
 
615 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00167  cyclic nucleotide binding protein  34.01 
 
 
608 aa  234  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0046  CBS domain-containing protein  28.78 
 
 
605 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.689982  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0046  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.48 
 
 
605 aa  232  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2622  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.89 
 
 
603 aa  232  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22370  hypothetical protein  28.7 
 
 
599 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000015085 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2693  hypothetical protein  25.91 
 
 
607 aa  224  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1453  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.89 
 
 
604 aa  210  9e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0634  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.55 
 
 
604 aa  208  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507059  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  29.52 
 
 
613 aa  192  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  29.48 
 
 
480 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  29.95 
 
 
637 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.84 
 
 
478 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  27.11 
 
 
626 aa  168  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  28.23 
 
 
629 aa  167  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 
629 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  27.83 
 
 
629 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  25.18 
 
 
637 aa  158  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  27.6 
 
 
626 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  27.29 
 
 
626 aa  155  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  27.85 
 
 
633 aa  153  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  27.41 
 
 
627 aa  152  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  22.97 
 
 
649 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  29.46 
 
 
629 aa  145  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0316  putative signal transduction protein with CBS domains  27.57 
 
 
576 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  24.15 
 
 
646 aa  140  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  28.69 
 
 
639 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  24.26 
 
 
645 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  27.06 
 
 
625 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  27.21 
 
 
618 aa  138  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  23.33 
 
 
646 aa  137  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  28.15 
 
 
641 aa  137  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  24.44 
 
 
645 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.32 
 
 
648 aa  135  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  25.91 
 
 
628 aa  135  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  27.27 
 
 
625 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.71 
 
 
649 aa  134  6.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.76 
 
 
660 aa  133  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  30.55 
 
 
623 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  27.03 
 
 
624 aa  132  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  24.82 
 
 
644 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3274  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.14 
 
 
596 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.877425  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  21.87 
 
 
639 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  24.29 
 
 
645 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  24.29 
 
 
645 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.2 
 
 
650 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.79 
 
 
635 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
624 aa  130  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.51 
 
 
596 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  27.9 
 
 
601 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2056  signal-transduction protein  25.57 
 
 
485 aa  128  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.120352 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  28.31 
 
 
645 aa  128  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  23.69 
 
 
644 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  23.55 
 
 
615 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  23.58 
 
 
615 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  26.55 
 
 
663 aa  127  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  24.68 
 
 
622 aa  127  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3824  CBS domain-containing protein  27.79 
 
 
605 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664828 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  26.46 
 
 
486 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.21 
 
 
625 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  23.42 
 
 
618 aa  125  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.25 
 
 
603 aa  123  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  25.79 
 
 
620 aa  123  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  26.06 
 
 
606 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  25.82 
 
 
620 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  23.35 
 
 
615 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  25.78 
 
 
615 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.59 
 
 
485 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.89 
 
 
615 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  25.78 
 
 
615 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.85 
 
 
603 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  25.78 
 
 
615 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  24.17 
 
 
648 aa  120  7.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.02 
 
 
667 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.85 
 
 
603 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1866  cyclic nucleotide-binding protein  26.36 
 
 
615 aa  120  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450839  normal  0.446941 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  26.04 
 
 
615 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  25.48 
 
 
615 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  25.06 
 
 
643 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  28.15 
 
 
623 aa  118  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2028  signal-transduction protein  26.29 
 
 
481 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.240016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  26.7 
 
 
638 aa  117  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>