More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3683 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  100 
 
 		 154 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  96.1 
 
 		 154 aa  290  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  95.48 
 
 		 161 aa  287  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  95.45 
 
 		 154 aa  270  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  82 
 
 		 152 aa  247  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  82.47 
 
 		 152 aa  242  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  81.82 
 
 		 152 aa  241  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  75.95 
 
 		 157 aa  207  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  75.32 
 
 		 157 aa  206  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  79.49 
 
 		 155 aa  204  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  61.35 
 
 		 166 aa  168  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  63.06 
 
 		 135 aa  167  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  64.14 
 
 		 136 aa  167  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  63.89 
 
 		 136 aa  166  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  58.97 
 
 		 226 aa  165  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  59.06 
 
 		 138 aa  160  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  58.9 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  61.59 
 
 		 131 aa  154  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  58.7 
 
 		 139 aa  153  7e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  63.77 
 
 		 135 aa  152  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  67.24 
 
 		 154 aa  151  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  56.64 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  59.71 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  60.71 
 
 		 127 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  58.27 
 
 		 126 aa  150  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  58.27 
 
 		 126 aa  150  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  60 
 
 		 124 aa  150  8e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  60 
 
 		 124 aa  150  8e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  58.27 
 
 		 126 aa  150  8e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  58.27 
 
 		 126 aa  150  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  84.52 
 
 		 174 aa  150  8.999999999999999e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  60 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  59.29 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  60 
 
 		 127 aa  147  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  58.33 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  57.97 
 
 		 124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  57.25 
 
 		 127 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  80.9 
 
 		 124 aa  145  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  53.47 
 
 		 142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1626  flagellar motor switch protein  84.34 
 
 		 129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  55.84 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2300  flagellar motor switch protein  71.43 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  81.18 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  54.86 
 
 		 143 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  54.86 
 
 		 162 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  54.86 
 
 		 165 aa  140  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  54.86 
 
 		 165 aa  140  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  54.86 
 
 		 162 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  54.86 
 
 		 162 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  79.76 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  56.93 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  54.55 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  79.76 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  70.79 
 
 		 153 aa  137  7e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  54.55 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  53.1 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  54.74 
 
 		 163 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  54.01 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  52.78 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  53.28 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  53.28 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  53.28 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  75 
 
 		 111 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  52.35 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  56.56 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  61.9 
 
 		 156 aa  130  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  69.88 
 
 		 111 aa  129  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  52.59 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  69.88 
 
 		 109 aa  128  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  60.71 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  71.43 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  73.49 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  73.49 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  49.32 
 
 		 175 aa  128  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  73.49 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 153 aa  127  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 170 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3073  flagellar motor switch protein FliN  48.34 
 
 		 149 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3799  flagellar motor switch protein FliN  48.34 
 
 		 149 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  49.31 
 
 		 180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  48.25 
 
 		 139 aa  124  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  66.32 
 
 		 142 aa  124  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  71.08 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  71.08 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  49.66 
 
 		 190 aa  120  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  65.88 
 
 		 142 aa  120  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0646  flagellar motor switch protein FliN  50.37 
 
 		 143 aa  120  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  66.27 
 
 		 155 aa  120  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  57.84 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  63.86 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  42.86 
 
 		 137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  41.56 
 
 		 137 aa  117  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  41.56 
 
 		 137 aa  117  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  41.56 
 
 		 137 aa  117  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  41.56 
 
 		 137 aa  117  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1121  flagellar motor switch protein FliN  65.06 
 
 		 163 aa  117  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.5679 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  41.56 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  57.89 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3438  flagellar motor switch protein FliN  53.61 
 
 		 99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>