55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1184 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1184  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432644  normal  0.172566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1166  hypothetical protein  89.25 
 
 		 307 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.533406  normal  0.0102803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1200  hypothetical protein  88.93 
 
 		 307 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4245  hypothetical protein  88.85 
 
 		 307 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.691144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0897  hypothetical protein  69.46 
 
 		 323 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0962881  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1048  hypothetical protein  68.23 
 
 		 323 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.766524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3304  hypothetical protein  62.37 
 
 		 300 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0196  hypothetical protein  42.32 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  27.39 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  33.19 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  28.99 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  23.84 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  28.85 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  24.54 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  30.51 
 
 		 308 aa  53.1  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.2 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2640  hypothetical protein  28.7 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  29.35 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  26.6 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  32.38 
 
 		 342 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  28.63 
 
 		 359 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  29.41 
 
 		 365 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  28.63 
 
 		 359 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  28.63 
 
 		 359 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  25.93 
 
 		 299 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 		 311 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.85 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  26.61 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  27.36 
 
 		 307 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  27.36 
 
 		 307 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.18 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  27.21 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.33 
 
 		 286 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.85 
 
 		 297 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  27.57 
 
 		 293 aa  45.8  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  40.98 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  26.99 
 
 		 335 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4331  hypothetical protein  27.56 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  26.16 
 
 		 322 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  37.33 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.54 
 
 		 348 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  40.74 
 
 		 333 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  26.89 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.2 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  26.87 
 
 		 309 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  25 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  38.89 
 
 		 395 aa  43.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  32.67 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1086  hypothetical protein  29.05 
 
 		 322 aa  43.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  25.57 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  31.71 
 
 		 316 aa  42.7  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.24 
 
 		 330 aa  42.7  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  42.11 
 
 		 286 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>