18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1086 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1086  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  652    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2719  hypothetical protein  21.4 
 
 
349 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0920499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2927  hypothetical protein  21.4 
 
 
349 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.133656  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2936  hypothetical protein  21.34 
 
 
351 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1166  hypothetical protein  23.93 
 
 
342 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.321304  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2309  hypothetical protein  20.91 
 
 
351 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0665308  hitchhiker  0.000000000134356 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2926  hypothetical protein  21.54 
 
 
349 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.6536e-25 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5626  hypothetical protein  22.91 
 
 
337 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154259  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0469  hypothetical protein  24.05 
 
 
370 aa  53.9  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2670  hypothetical protein  21.15 
 
 
349 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2966  hypothetical protein  21.07 
 
 
349 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2973  hypothetical protein  20.41 
 
 
349 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.834936  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4496  hypothetical protein  20.73 
 
 
367 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.871513  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2724  hypothetical protein  20.66 
 
 
351 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000748666  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3320  hypothetical protein  20.88 
 
 
337 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2642  hypothetical protein  22.58 
 
 
348 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227715  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2647  group-specific protein  31.75 
 
 
149 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1184  hypothetical protein  29.05 
 
 
306 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432644  normal  0.172566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>