16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5626 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5626  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  675    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154259  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2309  hypothetical protein  23.81 
 
 
351 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0665308  hitchhiker  0.000000000134356 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2966  hypothetical protein  23.57 
 
 
349 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2719  hypothetical protein  22.68 
 
 
349 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0920499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2927  hypothetical protein  22.68 
 
 
349 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.133656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2724  hypothetical protein  23.81 
 
 
351 aa  99.8  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000748666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2936  hypothetical protein  22.61 
 
 
351 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2926  hypothetical protein  22.36 
 
 
349 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.6536e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2670  hypothetical protein  22.04 
 
 
349 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2973  hypothetical protein  22.93 
 
 
349 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.834936  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1166  hypothetical protein  27.78 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.321304  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2642  hypothetical protein  24.77 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227715  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2647  group-specific protein  25.53 
 
 
149 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0535  hypothetical protein  32.05 
 
 
258 aa  56.6  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1086  hypothetical protein  22.91 
 
 
322 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0914  hypothetical protein  32.39 
 
 
269 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.320599  normal  0.183978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>