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for query gene PputW619_0872 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1271  major facilitator transporter  93.76 
 
 		 513 aa  908    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0872  major facilitator transporter  100 
 
 		 513 aa  1004    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4577  major facilitator transporter  93.76 
 
 		 513 aa  914    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0142  major facilitator transporter  70.02 
 
 		 511 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4454  major facilitator transporter  93.18 
 
 		 513 aa  877    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.544324  normal  0.740147 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3380  major facilitator superfamily MFS_1  64.4 
 
 		 509 aa  582  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.188058 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27430  putative multidrug efflux MFS transporter  59.7 
 
 		 530 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.700486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2320  major facilitator transporter  59.55 
 
 		 544 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0793665  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2125  major facilitator superfamily MFS_1  54.55 
 
 		 537 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5000  major facilitator transporter  54.3 
 
 		 535 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159102 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1697  major facilitator superfamily MFS_1  58.05 
 
 		 499 aa  534  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4488  major facilitator transporter  53.98 
 
 		 541 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1705  major facilitator superfamily MFS_1  52.05 
 
 		 553 aa  477  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46380  major facilitator superfamily protein  51.15 
 
 		 518 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2500  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 577 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.706515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1333  major facilitator transporter  49.12 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2303  major facilitator superfamily MFS_1  43.58 
 
 		 545 aa  442  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292812  normal  0.0663224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1156  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  42.59 
 
 		 524 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2527  major facilitator superfamily MFS_1  41.43 
 
 		 522 aa  363  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6435  major facilitator superfamily MFS_1  40.72 
 
 		 509 aa  346  7e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00900  inner membrane multidrug resistance transmembrane protein  41.54 
 
 		 498 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1820  putative transporter protein  39.07 
 
 		 457 aa  311  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.398976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1814  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 		 522 aa  243  7e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0912576 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3991  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.45 
 
 		 527 aa  233  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.93 
 
 		 529 aa  216  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 		 516 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 		 516 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.45 
 
 		 516 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  31.17 
 
 		 519 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  31.1 
 
 		 499 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1623  putative transport protein (permease)  31.55 
 
 		 545 aa  205  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.38 
 
 		 526 aa  203  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  30.62 
 
 		 539 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.27 
 
 		 535 aa  201  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.23 
 
 		 517 aa  199  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6362  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 526 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1466  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 526 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127999  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7029  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 526 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.97831  normal  0.626046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.32 
 
 		 535 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.6 
 
 		 516 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.4 
 
 		 535 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.4 
 
 		 535 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.93 
 
 		 527 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  28.13 
 
 		 534 aa  196  8.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
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NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.8 
 
 		 539 aa  194  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.41 
 
 		 526 aa  193  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.57 
 
 		 542 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.57 
 
 		 542 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.79 
 
 		 539 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.69 
 
 		 540 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 		 542 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 		 542 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.32 
 
 		 536 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.35 
 
 		 538 aa  186  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4968  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 529 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.24 
 
 		 543 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0208  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 527 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.58 
 
 		 523 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  29.41 
 
 		 529 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  27.87 
 
 		 524 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.11 
 
 		 514 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.6 
 
 		 519 aa  172  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.58 
 
 		 504 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.87 
 
 		 527 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.64 
 
 		 523 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.22 
 
 		 516 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0954  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 		 517 aa  158  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48300  putative MFS transporter  28.84 
 
 		 503 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  normal  0.132172 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.77 
 
 		 532 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.07 
 
 		 527 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.07 
 
 		 527 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.92 
 
 		 527 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.1 
 
 		 535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.52 
 
 		 532 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.58 
 
 		 532 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.38 
 
 		 530 aa  146  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3900  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.9 
 
 		 528 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3627  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.9 
 
 		 528 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126338  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4466  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.9 
 
 		 528 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.87368  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  26.63 
 
 		 528 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2192  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.19 
 
 		 528 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024166  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.19 
 
 		 528 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354181 
 
 
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NC_008391  Bamb_3275  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.19 
 
 		 528 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.37 
 
 		 530 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
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NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  27.29 
 
 		 508 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal  1 
 
 
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NC_010086  Bmul_4683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.06 
 
 		 529 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20572  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc2727  multidrug resistance transmembrane protein  26.29 
 
 		 511 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.29 
 
 		 536 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.95 
 
 		 520 aa  133  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.58 
 
 		 521 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.43 
 
 		 515 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_1182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.54 
 
 		 511 aa  133  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.77 
 
 		 515 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.48 
 
 		 537 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.05 
 
 		 532 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_2415  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.94 
 
 		 517 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  25.45 
 
 		 518 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_3836  MFS permease  23.24 
 
 		 525 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29674  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.17 
 
 		 526 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
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NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.77 
 
 		 527 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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