More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1420 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  100 
 
 		 243 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  95.08 
 
 		 244 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  95.08 
 
 		 244 aa  480  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  95.08 
 
 		 244 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  77.37 
 
 		 240 aa  394  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  71.49 
 
 		 242 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  71.49 
 
 		 242 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  73.19 
 
 		 241 aa  363  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  72.69 
 
 		 240 aa  362  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  71.43 
 
 		 240 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  46.55 
 
 		 233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  40.69 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  40.25 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  37.5 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  36.21 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  40.17 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  40 
 
 		 230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  35.65 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  40.08 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  34.93 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  38.56 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  36.82 
 
 		 243 aa  158  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  35.98 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.307649 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  35 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  32.76 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  33.85 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  32.62 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  32.62 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  31.76 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  32.51 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  34.42 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  29.54 
 
 		 238 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  31.03 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  29.32 
 
 		 252 aa  95.5  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  31.02 
 
 		 239 aa  95.5  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  28.64 
 
 		 236 aa  91.7  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  30.23 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  29 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  28.64 
 
 		 249 aa  85.9  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  35.52 
 
 		 236 aa  85.1  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  30.92 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  33.76 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  34.04 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  30.22 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  30.35 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  28.16 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  35.38 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  27.49 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  30.65 
 
 		 529 aa  72  0.000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  27.27 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  34.81 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  27.03 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  33.81 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  30.9 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08975  conserved hypothetical protein  28.14 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0643563  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00680  cytoplasm protein, putative  27.65 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822893  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47463  Predicted glutamine synthetase glutamine amidotransferase  29.33 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.881138 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  30.81 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  32.61 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  28.04 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3627  glutamine amidotransferase class-I  32.22 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  28.16 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  31.76 
 
 		 513 aa  65.9  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  29.28 
 
 		 520 aa  65.9  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  31.45 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2184  GMP synthase, large subunit  33.33 
 
 		 507 aa  65.5  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  31.79 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1937  GMP synthase large subunit  33.71 
 
 		 508 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000487266 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0942  GMP synthase, large subunit  31.82 
 
 		 535 aa  65.1  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00705801  normal  0.0196156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  31.71 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19190  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.84 
 
 		 536 aa  65.1  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0538351 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  33.13 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01005  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  30.73 
 
 		 509 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  33.33 
 
 		 522 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  29.63 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  24.88 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  37.39 
 
 		 525 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  30.67 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34923  predicted protein  27.6 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366717  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0600  GMP synthase  35.71 
 
 		 505 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0760838  hitchhiker  0.0000221926 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  35.4 
 
 		 528 aa  63.5  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1245  GMP synthase  37.19 
 
 		 539 aa  63.2  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10270  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.55 
 
 		 530 aa  63.2  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.38684 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  34.48 
 
 		 511 aa  62.8  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  32.11 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  28 
 
 		 231 aa  62  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_002950  PG0589  GMP synthase  33.13 
 
 		 506 aa  62  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  26.95 
 
 		 229 aa  62  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  27.31 
 
 		 520 aa  62  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  36.3 
 
 		 513 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  36.3 
 
 		 513 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  24.63 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  36.45 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  26.7 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  39.66 
 
 		 528 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  24.64 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  29.7 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  35.78 
 
 		 518 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  28.65 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  26 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>