More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1947 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1947  NifU domain-containing protein  100 
 
 		 133 aa  273  7e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  49.22 
 
 		 139 aa  136  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  47.54 
 
 		 123 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  49.59 
 
 		 125 aa  134  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.41 
 
 		 124 aa  133  8e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  52.76 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  47.54 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  47.97 
 
 		 149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  47.93 
 
 		 137 aa  130  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  49.18 
 
 		 144 aa  130  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.36 
 
 		 124 aa  130  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  48.36 
 
 		 145 aa  130  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  49.18 
 
 		 142 aa  130  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  46.67 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.58 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  46.28 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  50 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  49.14 
 
 		 173 aa  127  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0653  NifU domain-containing protein  44.72 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000132683  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  46.46 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  48.36 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  48.28 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  49.22 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  45.45 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  45.45 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  43.8 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  45.45 
 
 		 146 aa  120  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  42.15 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.61 
 
 		 298 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.09 
 
 		 277 aa  117  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.07 
 
 		 291 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2605  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.5 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000897774  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  44.07 
 
 		 291 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.7 
 
 		 309 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.86 
 
 		 286 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.07 
 
 		 284 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.62 
 
 		 154 aa  114  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.07 
 
 		 284 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  47.06 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.15 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.31 
 
 		 281 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.58 
 
 		 288 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  44.92 
 
 		 312 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.85 
 
 		 329 aa  111  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.62 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.22 
 
 		 283 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2443  NifU-like protein  40.52 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.37 
 
 		 344 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  45.9 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.18 
 
 		 207 aa  105  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  41.03 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1928  NifU domain-containing protein  44.14 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.46543  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.22 
 
 		 290 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.19 
 
 		 281 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  41.86 
 
 		 211 aa  104  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.54 
 
 		 286 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  43.7 
 
 		 285 aa  104  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.37 
 
 		 278 aa  103  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.4 
 
 		 309 aa  103  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0533  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.15 
 
 		 200 aa  103  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.52 
 
 		 306 aa  103  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.74 
 
 		 296 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.6 
 
 		 300 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  41.8 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  43.94 
 
 		 139 aa  100  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  40.48 
 
 		 211 aa  100  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.92 
 
 		 281 aa  99.8  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  40.91 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  41.67 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  41.67 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  42.28 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.53 
 
 		 284 aa  99  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  41.13 
 
 		 134 aa  98.6  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  42.5 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  43.9 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  39.53 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  42.5 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  43.33 
 
 		 137 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  40.32 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0889  scaffold protein  38.4 
 
 		 127 aa  97.4  5e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112954  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  40.65 
 
 		 128 aa  97.8  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5431  scaffold protein  40.91 
 
 		 135 aa  97.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  40.65 
 
 		 128 aa  97.8  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  40.8 
 
 		 128 aa  97.4  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1026  scaffold protein  43.09 
 
 		 133 aa  97.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00834233  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  40.83 
 
 		 133 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  41.94 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  41.94 
 
 		 139 aa  97.1  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  41.94 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1488  scaffold protein  41.67 
 
 		 135 aa  96.7  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.719074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2598  scaffold protein  41.67 
 
 		 135 aa  96.7  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662204  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1707  scaffold protein  41.67 
 
 		 135 aa  96.7  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2732  scaffold protein  41.67 
 
 		 135 aa  96.7  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2654  scaffold protein  41.67 
 
 		 135 aa  96.7  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  41.46 
 
 		 133 aa  97.1  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2216  scaffold protein  41.67 
 
 		 135 aa  96.7  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0835  NifU domain-containing protein  34.68 
 
 		 127 aa  97.1  8e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3104  scaffold protein  41.67 
 
 		 135 aa  96.7  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5952  scaffold protein  41.67 
 
 		 135 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2125  scaffold protein  41.67 
 
 		 135 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>