273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0015 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  508  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  37.34 
 
 
238 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  30.13 
 
 
244 aa  126  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  30.73 
 
 
222 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  32.88 
 
 
237 aa  123  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  27.56 
 
 
226 aa  122  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  32.06 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  29.61 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  29.32 
 
 
243 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  29.36 
 
 
222 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  30.04 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  29.81 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  33.5 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  32.71 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  26.99 
 
 
242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  32.5 
 
 
235 aa  108  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  33.19 
 
 
254 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  33.67 
 
 
237 aa  105  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  32.35 
 
 
245 aa  105  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  29.49 
 
 
242 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  28.5 
 
 
219 aa  104  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  29.17 
 
 
270 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  31.6 
 
 
238 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  26.58 
 
 
237 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  34.74 
 
 
242 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  29.91 
 
 
234 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  33.06 
 
 
246 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  33.06 
 
 
246 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  29.55 
 
 
227 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  29.55 
 
 
227 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  31.86 
 
 
258 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  27.56 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  29.55 
 
 
223 aa  99.8  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1164  hypothetical protein  40.52 
 
 
141 aa  98.2  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  31.02 
 
 
238 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  30.29 
 
 
243 aa  97.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  26.89 
 
 
221 aa  97.4  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0727  protein of unknown function DUF45  23.36 
 
 
223 aa  96.7  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  29.15 
 
 
218 aa  96.3  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  29.31 
 
 
481 aa  96.3  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  31.16 
 
 
254 aa  95.1  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  28.18 
 
 
224 aa  92.8  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  29.65 
 
 
288 aa  92.4  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  31.92 
 
 
242 aa  91.7  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  32.33 
 
 
320 aa  92  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  33.48 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0365  hypothetical protein  27.4 
 
 
232 aa  90.1  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0669057  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  33.04 
 
 
300 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  30.42 
 
 
319 aa  90.1  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  28.51 
 
 
318 aa  89.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  28.35 
 
 
340 aa  89.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  29.96 
 
 
253 aa  89  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  27.9 
 
 
239 aa  88.6  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  27.43 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  29.63 
 
 
314 aa  88.2  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  29.83 
 
 
235 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  26.36 
 
 
224 aa  88.2  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  30.56 
 
 
310 aa  88.2  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  28.05 
 
 
292 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  33.19 
 
 
242 aa  87  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  28.7 
 
 
292 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  30.53 
 
 
285 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0406  hypothetical protein  25.42 
 
 
257 aa  86.3  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.317112  normal  0.0115722 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  31.42 
 
 
285 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  27.8 
 
 
239 aa  86.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  29.91 
 
 
301 aa  86.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  26.82 
 
 
224 aa  85.9  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  25.88 
 
 
238 aa  85.9  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  32.65 
 
 
243 aa  85.9  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  29.41 
 
 
240 aa  85.9  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  30.84 
 
 
295 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  26.43 
 
 
235 aa  85.5  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  30.99 
 
 
217 aa  85.1  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  30.84 
 
 
303 aa  85.1  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  26.16 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  28.89 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  27.76 
 
 
240 aa  85.1  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  30.97 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  26.43 
 
 
235 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  30.84 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  30.84 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  33.18 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  32.87 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  29.2 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  25.99 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  25.99 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  29.08 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  25.88 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  33.75 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  29.74 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  28.22 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  32.72 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  27.31 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  28.69 
 
 
306 aa  82  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  25.55 
 
 
235 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  29.31 
 
 
292 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  25.55 
 
 
235 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  29.31 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  29.31 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  29.31 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>