133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1327 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1327  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 
265 aa  552  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4371  class II aldolase/adducin-like  47.84 
 
 
276 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717848  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6491  putative class II aldolase/adducin-like protein  36.98 
 
 
264 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800795  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3420  class II aldolase/adducin family protein  28.34 
 
 
253 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4368  class II aldolase/adducin family protein  28.5 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.5996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2138  class II aldolase/adducin family protein  26.09 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0849  hypothetical protein  26.61 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4135  class II aldolase/adducin family protein  23.31 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0804  class II aldolase/adducin domain protein  28.96 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.864607  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4349  class II aldolase/adducin family protein  29.74 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  35.35 
 
 
222 aa  63.2  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1684  class II aldolase/adducin-like protein  25.76 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1713  class II aldolase/adducin family protein  25.76 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.938397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0543  class II aldolase/adducin family protein  25.76 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1657  class II aldolase/adducin family protein  25.76 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0540  class II aldolase/adducin family protein  25.76 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0622  class II aldolase/adducin family protein  25.76 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  23.83 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  26.4 
 
 
301 aa  59.7  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  26.24 
 
 
260 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1000  class II aldolase/adducin domain protein  25.93 
 
 
260 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4614  class II aldolase/adducin domain protein  25.23 
 
 
260 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  hitchhiker  0.00381472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  26.24 
 
 
260 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5245  class II aldolase/adducin domain protein  25.23 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  25.67 
 
 
215 aa  59.3  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5614  class II aldolase/adducin domain protein  25.23 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0752724  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1161  class II aldolase/adducin domain protein  25.93 
 
 
260 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1007  class II aldolase/adducin domain protein  25.93 
 
 
260 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5443  class II aldolase/adducin domain protein  24.65 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00180883  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  28.57 
 
 
214 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  29.09 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  25.43 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0077  class II aldolase/adducin domain protein  24.31 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0421444  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  22.95 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4893  class II aldolase/adducin domain protein  24.65 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0507067 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4303  class II aldolase/adducin domain protein  25.89 
 
 
262 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891034  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  22.83 
 
 
271 aa  57  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0233  hypothetical protein  24.68 
 
 
260 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  23.73 
 
 
219 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0929  class II aldolase/adducin family protein  24.02 
 
 
239 aa  55.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  26.45 
 
 
214 aa  55.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  25.68 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2482  class II aldolase/adducin family protein  27.32 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000186834  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0451  class II aldolase/adducin domain protein  25.48 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  24.77 
 
 
260 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1569  class II aldolase/adducin domain protein  24.88 
 
 
260 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  25.95 
 
 
213 aa  52.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01660  decarboxylase protein  23.47 
 
 
222 aa  52.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.552729  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  24.02 
 
 
260 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  24.64 
 
 
301 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.795367 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2037  class II aldolase/adducin domain protein  24.62 
 
 
260 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  21.98 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  25.25 
 
 
214 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3705  class II aldolase/adducin domain protein  24.62 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993154  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  24.04 
 
 
227 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1957  class II aldolase/adducin domain protein  25.52 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0957  class II aldolase/adducin domain protein  25.52 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0868  class II aldolase/adducin domain protein  25.52 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0280  class II aldolase/adducin domain protein  25.52 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.594918  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  21.76 
 
 
282 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  22.97 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  21.76 
 
 
281 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  22.1 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1648  class II aldolase/adducin family protein  23.53 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  24.51 
 
 
207 aa  50.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  22.28 
 
 
244 aa  50.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4174  L-fuculose-phosphate aldolase  24.12 
 
 
218 aa  49.7  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  21.02 
 
 
263 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  24.82 
 
 
220 aa  49.7  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4108  class II aldolase/adducin domain protein  21.7 
 
 
258 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29216  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  20.71 
 
 
268 aa  49.3  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4082  hypothetical protein  27.52 
 
 
280 aa  49.3  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2494  L-fuculose-phosphate aldolase  27.1 
 
 
222 aa  48.9  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0873  class II aldolase/adducin-like  23.98 
 
 
242 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.137021  normal  0.149254 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  25.89 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2398  L-fuculose-phosphate aldolase  24.86 
 
 
214 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.064801  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  24.6 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2271  class II aldolase/adducin-like  30.48 
 
 
197 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.453989  hitchhiker  0.000307852 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  22.28 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  22.62 
 
 
283 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  21.03 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4438  class II aldolase/adducin domain protein  23.66 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3663  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.37 
 
 
213 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  28.22 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43970  class II aldolase protein  21.08 
 
 
276 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.748623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1062  class II aldolase/adducin family protein  25.63 
 
 
213 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138135  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5614  class II aldolase/adducin family protein  25.89 
 
 
248 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.991277  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  23.39 
 
 
211 aa  47.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2791  L-fuculose-phosphate aldolase  26.52 
 
 
223 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  26.15 
 
 
259 aa  46.6  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  24.73 
 
 
254 aa  46.2  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  25.51 
 
 
428 aa  46.6  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  26.67 
 
 
214 aa  46.2  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  21.3 
 
 
222 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4246  class II aldolase/adducin family protein  23.42 
 
 
247 aa  46.2  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0324  class II aldolase/adducin family protein  29.09 
 
 
218 aa  45.8  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  27.18 
 
 
251 aa  45.8  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  23.86 
 
 
271 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  22.93 
 
 
326 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4089  class II aldolase/adducin family protein  26.4 
 
 
234 aa  45.4  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117914 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>