82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01660 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01660  decarboxylase protein  100 
 
 		 222 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.552729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3551  HCOMODA decarboxylase (CmtD)  54.09 
 
 		 244 aa  228  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161109  normal  0.205223 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2893  class II aldolase/adducin family protein  52.47 
 
 		 243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.582162 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6491  putative class II aldolase/adducin-like protein  30.67 
 
 		 264 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4371  class II aldolase/adducin-like  32.88 
 
 		 276 aa  89  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2138  class II aldolase/adducin family protein  35.11 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1062  class II aldolase/adducin family protein  34.76 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138135  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4135  class II aldolase/adducin family protein  29.78 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  30.63 
 
 		 428 aa  54.3  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0849  hypothetical protein  26.27 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5443  class II aldolase/adducin domain protein  28.1 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00180883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4893  class II aldolase/adducin domain protein  28.1 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0507067 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4349  class II aldolase/adducin family protein  32.07 
 
 		 239 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4614  class II aldolase/adducin domain protein  27.27 
 
 		 260 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  hitchhiker  0.00381472 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5614  class II aldolase/adducin domain protein  27.27 
 
 		 260 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0752724  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5245  class II aldolase/adducin domain protein  27.27 
 
 		 260 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1000  class II aldolase/adducin domain protein  30.43 
 
 		 260 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  29.95 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0523  L-fuculose-phosphate aldolase  25.95 
 
 		 231 aa  51.6  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1007  class II aldolase/adducin domain protein  30.43 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  27.83 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1161  class II aldolase/adducin domain protein  30.43 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0077  class II aldolase/adducin domain protein  27.27 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0421444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4708  class II aldolase/adducin-like  27.23 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2684  class II aldolase/adducin family protein  31.25 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  0.449845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  27.83 
 
 		 260 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0208  hypothetical protein  22.34 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.720455  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  27.83 
 
 		 260 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0804  class II aldolase/adducin domain protein  29.6 
 
 		 260 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.864607  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0947  class II aldolase/adducin family protein  29.82 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0283  class II aldolase/adducin domain protein  29.6 
 
 		 260 aa  48.9  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.711177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1569  class II aldolase/adducin domain protein  27.83 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1957  class II aldolase/adducin domain protein  30 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0451  class II aldolase/adducin domain protein  30.17 
 
 		 261 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1327  class II aldolase/adducin family protein  25.24 
 
 		 265 aa  47.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  28.57 
 
 		 332 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0957  class II aldolase/adducin domain protein  30 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0280  class II aldolase/adducin domain protein  30 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.594918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0868  class II aldolase/adducin domain protein  30 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  26.63 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  27.81 
 
 		 263 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3705  class II aldolase/adducin domain protein  27.83 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2037  class II aldolase/adducin domain protein  27.83 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4368  class II aldolase/adducin family protein  28.08 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.5996  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  27.54 
 
 		 263 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  26.35 
 
 		 263 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  26.32 
 
 		 262 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  26.35 
 
 		 268 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4438  class II aldolase/adducin domain protein  29.31 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3215  class II aldolase/adducin family protein  24.43 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.549465  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3233  aldolase II superfamily protein  26.56 
 
 		 274 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2702  class II aldolase/adducin family protein  30.08 
 
 		 244 aa  45.1  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00187501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1648  class II aldolase/adducin family protein  27.5 
 
 		 276 aa  45.4  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1684  class II aldolase/adducin-like protein  28.12 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  28.5 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  27.18 
 
 		 262 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  24.47 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1657  class II aldolase/adducin family protein  28.12 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1713  class II aldolase/adducin family protein  28.12 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.938397 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  26.09 
 
 		 260 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  28.5 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0543  class II aldolase/adducin family protein  28.12 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0622  class II aldolase/adducin family protein  28.12 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0540  class II aldolase/adducin family protein  28.12 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4810  class II aldolase/adducin family protein  29.47 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.86803  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3557  aldolase II superfamily protein  26.56 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  37.89 
 
 		 332 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  28.31 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  25.81 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4108  class II aldolase/adducin domain protein  27.83 
 
 		 258 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  26.16 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  27.61 
 
 		 262 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  28.5 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  27.54 
 
 		 263 aa  42.4  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  28.12 
 
 		 257 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  26.45 
 
 		 280 aa  42.4  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2784  class II aldolase/adducin family protein  31.4 
 
 		 213 aa  42  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  25.15 
 
 		 261 aa  42  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  26.79 
 
 		 256 aa  42  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  26.79 
 
 		 264 aa  42  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  33.7 
 
 		 385 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0873  class II aldolase/adducin-like  23.02 
 
 		 242 aa  41.6  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.137021  normal  0.149254 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>