More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1232 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  100 
 
 		 301 aa  600  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1099  Patatin  88.43 
 
 		 216 aa  374  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  56.09 
 
 		 318 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  62.17 
 
 		 318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  65.35 
 
 		 319 aa  335  5e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  64.98 
 
 		 316 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  62.93 
 
 		 311 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  55.81 
 
 		 317 aa  291  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  57.48 
 
 		 315 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  55.81 
 
 		 349 aa  288  8e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  56.76 
 
 		 306 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  56.76 
 
 		 305 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  56.76 
 
 		 305 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  56.37 
 
 		 308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  56.37 
 
 		 302 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  55.98 
 
 		 474 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  55.98 
 
 		 347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  55.98 
 
 		 347 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  55.98 
 
 		 306 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  55.98 
 
 		 302 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  55.47 
 
 		 323 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  55.98 
 
 		 347 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  55.21 
 
 		 358 aa  279  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  59.32 
 
 		 358 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  55.74 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  56.67 
 
 		 298 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  55.42 
 
 		 347 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  55.42 
 
 		 347 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  50.56 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  50.99 
 
 		 308 aa  255  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  52.8 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  49.02 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  49.02 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  48.84 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  47.83 
 
 		 346 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  47.88 
 
 		 345 aa  228  8e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  47.43 
 
 		 348 aa  218  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  58.58 
 
 		 223 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  37.9 
 
 		 334 aa  186  3e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  38.57 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  37.85 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  39.45 
 
 		 273 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  37.85 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  39.52 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  37.45 
 
 		 263 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  37.45 
 
 		 263 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  37.05 
 
 		 263 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  37.05 
 
 		 263 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  37.05 
 
 		 263 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  37.15 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  37.05 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  36.65 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  37.05 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  37.65 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  36 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  38.82 
 
 		 262 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  37.8 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  37.8 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  37.8 
 
 		 333 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  36.05 
 
 		 260 aa  162  8.000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  35.86 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2248  patatin  36.97 
 
 		 346 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000483093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  35.95 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  36.07 
 
 		 803 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  36.07 
 
 		 803 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  36.07 
 
 		 803 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  36.47 
 
 		 320 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  35.4 
 
 		 727 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  32.47 
 
 		 304 aa  149  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  33.87 
 
 		 253 aa  149  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  34.85 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  35.46 
 
 		 751 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  36.57 
 
 		 748 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  41.62 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  35.46 
 
 		 728 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  35.27 
 
 		 945 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  35.27 
 
 		 933 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  33.85 
 
 		 272 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  33.71 
 
 		 275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  35.27 
 
 		 728 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  35.53 
 
 		 728 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  35.27 
 
 		 920 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  35.46 
 
 		 728 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  35.27 
 
 		 930 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  34.75 
 
 		 852 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  36.8 
 
 		 813 aa  145  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  35.93 
 
 		 804 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  35.56 
 
 		 796 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  35.13 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  34.27 
 
 		 667 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  32.7 
 
 		 275 aa  143  4e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  34.41 
 
 		 292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  35.58 
 
 		 798 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1715  patatin  33.85 
 
 		 310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000010772 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  35.47 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  32.7 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1719  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00963629  normal  0.824632 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1907  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163252  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  35.94 
 
 		 728 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>