157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1183 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1183  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  565  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.716551  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1645  hypothetical protein  53.14 
 
 
272 aa  308  8e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2955  hypothetical protein  38.28 
 
 
283 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2835  hypothetical protein  36.96 
 
 
284 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1263  hypothetical protein  33.46 
 
 
276 aa  169  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00802611  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0400  hypothetical protein  33.58 
 
 
274 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  0.731684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1738  hypothetical protein  33.58 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3788  hypothetical protein  31.95 
 
 
276 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  33.57 
 
 
285 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1431  esterase/lipase-like protein  33.7 
 
 
283 aa  158  8e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1658  hypothetical protein  33.96 
 
 
305 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0649  esterase/lipase-like protein  34.72 
 
 
284 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.658651  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4489  putative esterase  30.31 
 
 
301 aa  152  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1599  hypothetical protein  32.46 
 
 
278 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0504  hypothetical protein  32.46 
 
 
278 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.368816  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1759  hypothetical protein  32.46 
 
 
278 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1574  hypothetical protein  32.46 
 
 
278 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3396  hypothetical protein  32.45 
 
 
281 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150599  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1370  esterase/lipase  33.21 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.194739  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0652  hypothetical protein  33.21 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5829  esterase  33.21 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000904381 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2125  Arylformamidase  32.33 
 
 
266 aa  146  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1550  esterase  33.96 
 
 
288 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00157882 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18460  hypothetical protein  34.04 
 
 
296 aa  146  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1624  esterase/lipase-like protein  32.22 
 
 
275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0914891  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1666  esterase/lipase-like protein  32.59 
 
 
275 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658867  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5100  esterase/lipase-like protein  32.1 
 
 
272 aa  141  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1215  esterase/lipase-like protein  32.09 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1694  esterase/lipase-like protein  32.09 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3090  esterase/lipase-like protein  31.15 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4855  esterase/lipase-like protein  31.23 
 
 
304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1602  esterase/lipase-like protein  32.06 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.872015  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3168  putative esterase  29.67 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000470113  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3448  putative esterase/lipase  30.11 
 
 
284 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666371 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0322  hypothetical protein  30.29 
 
 
271 aa  122  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.104555  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2702  hypothetical protein  28.26 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6510  putative hydrolase (Serine esterase)  29.24 
 
 
274 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149214  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  27.74 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  25.78 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0624  putative esterase  26.39 
 
 
296 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0312234 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2976  hypothetical protein  30.15 
 
 
303 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  28.46 
 
 
285 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2822  hypothetical protein  28.37 
 
 
313 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1199  putative esterase/lipase  30.5 
 
 
280 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0258  hypothetical protein  28.36 
 
 
256 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5000  putative esterase/lipase/thiestherase protein  26.12 
 
 
282 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101002  normal  0.508261 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2492  putative esterase/lipase/thioesterase  25.46 
 
 
261 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.62 
 
 
294 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01721  hypothetical protein  23.99 
 
 
308 aa  98.6  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2888  putative alpha/beta hydrolase  27.55 
 
 
257 aa  98.6  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000241546  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1533  hypothetical protein  27.66 
 
 
288 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1402  putative esterase  25.57 
 
 
324 aa  91.3  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4004  hypothetical protein  26.55 
 
 
271 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0220  esterase/lipase-like protein  24.54 
 
 
277 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5258  hypothetical protein  26.16 
 
 
283 aa  82  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1010  esterase/lipase/thioesterase  24.91 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2671  putative esterase/lipase/thioesterase  24.91 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0511  LipQ  31.82 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122421  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5243  putative esterase  28.46 
 
 
291 aa  79  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.601639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1153  putative esterase  28.74 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0591042  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  33.8 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.68 
 
 
288 aa  68.9  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.95 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  27.97 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  24.12 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.03 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1434  Esterase/lipase-like protein  26.25 
 
 
294 aa  63.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  32.06 
 
 
316 aa  62  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.46 
 
 
311 aa  60.1  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  24.23 
 
 
294 aa  59.7  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  25.11 
 
 
412 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.53 
 
 
297 aa  59.3  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.73 
 
 
300 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  25 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  25.11 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  25.11 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  25.22 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  25.55 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2196  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.72 
 
 
316 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266985  normal  0.0102388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.34 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3154  esterase/lipase/thioesterase  28.48 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.246115  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.9 
 
 
300 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  30.37 
 
 
310 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  29.51 
 
 
286 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.93 
 
 
302 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  24.02 
 
 
309 aa  55.8  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  26.14 
 
 
300 aa  55.8  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.48 
 
 
360 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.49 
 
 
349 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0469  carboxylesterase family protein  23.92 
 
 
406 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.97 
 
 
301 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.17 
 
 
336 aa  53.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.97 
 
 
301 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.83 
 
 
336 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5847  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  21.84 
 
 
319 aa  52.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  32.29 
 
 
308 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0112  hypothetical protein  31.9 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1997  carboxylesterase family protein  26.85 
 
 
297 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3323  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  20.35 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0601225  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1092  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.32 
 
 
277 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>