290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4528 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4528  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 423 aa  806    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.050595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1512  major facilitator superfamily transporter  63.97 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2695  major facilitator superfamily transporter  58.85 
 
 		 437 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0167  major facilitator superfamily permease  34.54 
 
 		 426 aa  156  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4848  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 406 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.869631  normal  0.114324 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4365  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1714  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 		 435 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5331  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 		 435 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  24.29 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  26.01 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39850  putative MFS transporter  31.31 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  24.28 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  25.75 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 407 aa  66.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  31.16 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  31.29 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  23.61 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  25.5 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 		 390 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2776  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.978343 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  25.53 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  25.81 
 
 		 403 aa  59.7  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  29.94 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  31.33 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  31.91 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  29.94 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3377  MFS family transporter  29.19 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0683308  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  30.63 
 
 		 399 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0278  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0762  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25.94 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  34.97 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2885  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 409 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.281553  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2805  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.438181 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  22.44 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00890  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15490)  25.96 
 
 		 591 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.525892 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0795  multidrug resistance protein  27.81 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0744  multidrug resistance protein B  27.81 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2900  hypothetical protein  29.38 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0930  multidrug resistance protein  27.81 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2108e-39 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0835  multidrug resistance protein  27.81 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0719819  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  33.12 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2277  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 407 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0731  multidrug resistance protein B  27.33 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2753  hypothetical protein  29.76 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 426 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 414 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2897  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4422  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  22.98 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 398 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 398 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0890  multidrug resistance protein  27.15 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.742643  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  30 
 
 		 398 aa  54.3  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 421 aa  53.9  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  21.61 
 
 		 424 aa  53.5  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  28 
 
 		 400 aa  53.5  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  26.32 
 
 		 411 aa  53.5  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  28.57 
 
 		 411 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 398 aa  53.1  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0928  multidrug resistance protein  26.67 
 
 		 400 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 400 aa  53.1  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  26.67 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87422  MFS family transporter: multidrug efflux  32.46 
 
 		 477 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.99935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  26.67 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2610  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>