46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3653 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3653  chorismate mutase  100 
 
 		 104 aa  210  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4456  chorismate mutase  79.17 
 
 		 105 aa  155  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0443  chorismate mutase  50.5 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259409 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0357  Chorismate mutase  51.49 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0367  chorismate mutase  51.49 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0753  chorismate mutase  48.51 
 
 		 116 aa  94.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4076  chorismate mutase  46.67 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3271  chorismate mutase  45.56 
 
 		 109 aa  86.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2059  Chorismate mutase  41.67 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  45.45 
 
 		 475 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3570  chorismate mutase  40 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2350  chorismate mutase  44.9 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2170  chorismate mutase family protein  39.36 
 
 		 232 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0569  chorismate mutase  40.43 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1986  chorismate mutase  37.78 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  41.18 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0309  chorismate mutase  32.63 
 
 		 100 aa  63.5  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0787  chorismate mutase  32.69 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1269  normal  0.218255 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0662  chorismate mutase  44.83 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2315  chorismate mutase  44.83 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.275699 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1346  chorismate mutase related enzyme  31.91 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2596  isochorismate pyruvate-lyase  28.85 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.878016  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0015  chorismate mutase family protein  32.98 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2939  Chorismate mutase  36.47 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2321  chorismate mutase  38.27 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0789941  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  45.12 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0570  chorismate mutase  42.53 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2047  Chorismate mutase  37.36 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2163  chorismate mutase family protein  32.98 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3163  isochorismate-pyruvate lyase  32.63 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2759  isochorismate-pyruvate lyase  32.63 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0261778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1139  chorismate mutase  36.36 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1284  chorismate mutase related enzyme  34.83 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0206152  normal  0.407727 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1555  hypothetical protein  32.53 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.302636  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  32.53 
 
 		 372 aa  47.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2357  chorismate mutase  29.7 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2146  isochorismate-pyruvate lyase  30.43 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1832  isochorismate-pyruvate lyase  30.95 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.46106  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3678  Chorismate mutase  41.98 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0872  isochorismate-pyruvate lyase  29.35 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0782  isochorismate-pyruvate lyase  29.35 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0169  chorismate mutase-related enzyme  50 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32 
 
 		 358 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  30.95 
 
 		 358 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  33.33 
 
 		 359 aa  41.2  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0155  chorismate mutase  32.88 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>