77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2523 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2523  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 145 aa  289  7e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4532  transposase IS3/IS911 family protein  85.14 
 
 		 148 aa  197  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1410  transposase IS3/IS911 family protein  47.26 
 
 		 147 aa  115  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3090  transposase IS3/IS911 family protein  47.26 
 
 		 147 aa  115  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2291  transposase IS3/IS911 family protein  42.76 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112265  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  32.93 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  37.4 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  36.71 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0340  transposase IS3/IS911  63.46 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394046  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  32.94 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7466  transposase IS3/IS911 family protein  35.66 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6181  hypothetical protein  35.29 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  45.9 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2548  putative transposase, ISPpu14 Orf1 like  32.84 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3738  putative transposase  32.84 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0080  putative ISPpu14, transposase Orf1  32.84 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.195214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0063  putative transposase  32.84 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6339  transposase IS3/IS911  32.14 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6377  helix-turn-helix, Fis-type  34.11 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1729  transposase  29.5 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7615  transposase IS3/IS911 family protein  29.08 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.557321  normal  0.767348 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0524  hypothetical protein  44.68 
 
 		 331 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104385  hitchhiker  0.00639859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0518  hypothetical protein  59.46 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1168  transposase IS3/IS911 family protein  35.82 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.375824  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0835  transposase IS3/IS911 family protein  35.82 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.333335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2667  transposase IS3/IS911 family protein  35.82 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2977  transposase IS3/IS911 family protein  35.82 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0712  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  41.46 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  31.87 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  41.46 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  41.46 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  41.46 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  41.46 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  40.38 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5995  hypothetical protein  40.3 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  41.46 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  41.46 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  45.45 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  45.45 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  45.45 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  45.45 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  45.45 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  41.46 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  40.38 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  40.38 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  40.38 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  40.38 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  40.38 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  40.38 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  40.38 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  40.38 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  40.38 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  40.38 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4330  hypothetical protein  40.38 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2805  transposase IS3/  57.58 
 
 		 37 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0472  putative transposase IS3/IS911  23.16 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6372  transposase ISRme19  31.07 
 
 		 125 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092485 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  57.58 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6859  transposase IS3/IS911 family protein  30.09 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643706  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3089  hypothetical protein  31.63 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000589591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2889  hypothetical protein  31.63 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2737  hypothetical protein  31.63 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0586218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  31.63 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1452  hypothetical protein  31.63 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3142  hypothetical protein  31.63 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  31.63 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1441  hypothetical protein  31.63 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1101  hypothetical protein  31.63 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0229521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0077  hypothetical protein  31.63 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  25.24 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>