121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0772 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0772  ribosomal protein L30  100 
 
 		 61 aa  122  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  49.15 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  44.26 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1929  50S ribosomal protein L30  41.67 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.630046 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1143  ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000025708  normal  0.0109898 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  45 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  45 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  44.26 
 
 		 61 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1928  50S ribosomal protein L30  39.34 
 
 		 76 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1951  50S ribosomal protein L30  39.34 
 
 		 76 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2036  50S ribosomal protein L30  39.34 
 
 		 76 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3887  50S ribosomal protein L30  46.67 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  49.18 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  45 
 
 		 60 aa  51.2  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  41.67 
 
 		 60 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  42.62 
 
 		 61 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2278  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000449635  hitchhiker  0.00309208 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2921  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000749762  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  41.67 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1358  ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 61 aa  50.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  43.33 
 
 		 60 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  43.33 
 
 		 60 aa  50.4  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 66 aa  50.4  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1833  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2405  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137776  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0199  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.166144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  41.67 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  45 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  45.9 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2211  50S ribosomal protein L30  45.9 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000289447  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3006  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.319275  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0307  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0473987  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  43.33 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0269  ribosomal protein L30  41.67 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2046  50S ribosomal protein L30  39.66 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00780916  normal  0.406407 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  43.33 
 
 		 60 aa  47.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2601  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 58 aa  47.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3399  ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34793  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 59 aa  47  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0774  50S ribosomal protein L30  41.07 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.797874  normal  0.0109513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  40.68 
 
 		 59 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2839  50S ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 59 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 59 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  40.68 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04502  50S ribosomal protein L30  41.07 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17741  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0212  LSU ribosomal protein L30P  43.1 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161029  normal  0.28126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0951  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 59 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0200139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3310  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 59 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129618 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  44.07 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  37.7 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  39.66 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0612  50S ribosomal protein L30  38.33 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0237089  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5142  ribosomal protein L30  38.98 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0678  ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 58 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1310  50S ribosomal protein L30  52 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988415  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1376  50S ribosomal protein L30  52 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0327114  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1725  50S ribosomal protein L30  39.66 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000657277  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  36.07 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  37.93 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0213  50S ribosomal protein L30  38.98 
 
 		 60 aa  43.9  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00000348111  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1084  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.055199  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0179  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  35.59 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2889  ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1500  ribosomal protein L30P  40.38 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000706329  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2239  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.108053  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  40 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  37.04 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0273  50S ribosomal protein L30  40.35 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0832356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  40.35 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23290  LSU ribosomal protein L30P  48.21 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  hitchhiker  0.00000565029 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1556  ribosomal protein L30  38.33 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000500993  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3688  ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00000284143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2696  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 57 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2381  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 57 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1465  50S ribosomal protein L30  37.29 
 
 		 60 aa  41.6  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>