36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1500 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1500  ribosomal protein L30P  100 
 
 		 158 aa  320  5e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000706329  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0585  50S ribosomal protein L30P  52.63 
 
 		 153 aa  179  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0102  50S ribosomal protein L30P  51.32 
 
 		 153 aa  177  4.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.805904 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2232  50S ribosomal protein L30P  53.95 
 
 		 153 aa  176  9e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17243  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0463  50S ribosomal protein L30P  53.29 
 
 		 153 aa  176  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0553  50S ribosomal protein L30P  52.29 
 
 		 154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.929713  normal  0.433723 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1405  50S ribosomal protein L30P  56.21 
 
 		 154 aa  169  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0089  50S ribosomal protein L30P  49.34 
 
 		 153 aa  169  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0139632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0022  50S ribosomal protein L30P  46.71 
 
 		 153 aa  151  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000081539  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0158  50S ribosomal protein L30P  53.24 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0191221  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1253  50S ribosomal protein L30P  53.24 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0343817  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0665  50S ribosomal protein L30P  53.24 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00686954 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1707  50S ribosomal protein L30P  47.37 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144024  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0235  50S ribosomal protein L30P  48.03 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0731  50S ribosomal protein L30P  50.71 
 
 		 154 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125981  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1307  50S ribosomal protein L30P  45.45 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.313332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0778  50S ribosomal protein L30P  43.37 
 
 		 179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1849  ribosomal protein L30P  38.31 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685217 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0314  50S ribosomal protein L30P  44.24 
 
 		 176 aa  119  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1057  50S ribosomal protein L30P  41.76 
 
 		 185 aa  117  7.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.022347  hitchhiker  0.0000000491432 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1207  50S ribosomal protein L30P  40.36 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2313  50S ribosomal protein L30P  38.96 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.156993  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2239  ribosomal protein L30P  37.42 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1757  ribosomal protein L30P  41.94 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.113984  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2428  50S ribosomal protein L30P  37.01 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0231  ribosomal protein L30P  37.42 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0112  50S ribosomal protein L30P  33.33 
 
 		 153 aa  94.4  6e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000210294  unclonable  0.000000357235 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0400  50S ribosomal protein L30P  31.13 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0676264 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30488  Ribosomal protein L7, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  32.3 
 
 		 239 aa  67.8  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.655179 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22774  predicted protein  31.45 
 
 		 239 aa  67  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66370  60S large subunit ribosomal protein  29.7 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.78437  normal  0.0538769 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06360  60s ribosomal protein l7, putative  30.38 
 
 		 250 aa  50.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07107  60S ribosomal protein L7 (AFU_orthologue; AFUA_4G03880)  29.45 
 
 		 251 aa  48.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.135694  normal  0.632597 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14450  predicted protein  27.61 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  38.6 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0772  ribosomal protein L30  40.38 
 
 		 61 aa  42.4  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>