146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1928 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1928  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 76 aa  151  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1951  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 76 aa  151  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2036  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 76 aa  151  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1929  50S ribosomal protein L30  81.82 
 
 		 79 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.630046 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4225  ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00829354  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2151  ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 59 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0556857  normal  0.316331 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0423  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.60192  normal  0.209018 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3001  50S ribosomal protein L30  53.85 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3161  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158521  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3465  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155512  normal  0.071059 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2741  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0301719  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0285  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104363  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0366  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139804  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0345  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0294  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000487608  normal  0.0630356 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0332  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00936849  decreased coverage  0.00323406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3626  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000585179  hitchhiker  0.0000000000133791 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0399  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0267  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.16996  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2614  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3758  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0279178  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3050  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0897802  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2821  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238696  normal  0.243188 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3151  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0153482  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3425  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1942  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3728  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00881974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3786  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3496  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0391  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000847959  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0774  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.797874  normal  0.0109513 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04502  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17741  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0772  ribosomal protein L30  39.34 
 
 		 61 aa  53.5  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0068  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  53.5  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.02253  hitchhiker  0.000000000000613726 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2307  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.227659  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0071  50S ribosomal protein L30  51.92 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.230621  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1040  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0619  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.268532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3931  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0493  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0840  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0678  ribosomal protein L30  50 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5052  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0451  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 63 aa  50.8  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.610565  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 58 aa  50.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0338  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0500477  hitchhiker  0.00104601 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  49.02 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  49.02 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  49.02 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  49.02 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  49.02 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  49.02 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  49.02 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  49.02 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09030  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 58 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0258453  normal  0.264293 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0737  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000491198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0855  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 58 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.342105  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  47.06 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0297  50S ribosomal protein L30P  48.15 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000000859668  hitchhiker  0.00000207421 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  40 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0341  ribosomal protein L30  41.07 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000260811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  47.06 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06430  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340792  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0212  LSU ribosomal protein L30P  46.55 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161029  normal  0.28126 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0785  ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000912341  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  47.06 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0345  50S ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 61 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0515  50S ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 61 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181031  unclonable  0.0000000000137591 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2839  50S ribosomal protein L30  38.89 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 59 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2306  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0951  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0200139  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 59 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 59 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3310  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0472  50S ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 58 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291193  hitchhiker  0.00000269713 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  40.35 
 
 		 60 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0644  ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104733  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4530  50S ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0070404  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5061  50S ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 58 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000009319  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2239  50S ribosomal protein L30  48.08 
 
 		 56 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.108053  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0313  ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00845621  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0505  50S ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 58 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00113735  normal  0.0573997 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00956  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0648954  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0502  50S ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 58 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000122641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4731  50S ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 58 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000152085  normal  0.600234 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0512  50S ribosomal protein L30  46 
 
 		 53 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.263317  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2442  50S ribosomal protein L30P  36.67 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0273  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0832356  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1747  50S ribosomal protein L30  48.08 
 
 		 56 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.652105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0097  50S ribosomal protein L30  46.15 
 
 		 56 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.108985 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  38.33 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>