163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0512 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0512  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 53 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.263317  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0451  50S ribosomal protein L30  92.45 
 
 		 63 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.610565  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0774  50S ribosomal protein L30  62.75 
 
 		 63 aa  70.5  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.797874  normal  0.0109513 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04502  50S ribosomal protein L30  62.75 
 
 		 63 aa  70.1  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17741  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0071  50S ribosomal protein L30  53.06 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.230621  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0068  50S ribosomal protein L30  53.06 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.02253  hitchhiker  0.000000000000613726 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3161  50S ribosomal protein L30  53.06 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158521  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  53.06 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3001  50S ribosomal protein L30  53.06 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2821  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238696  normal  0.243188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3626  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000585179  hitchhiker  0.0000000000133791 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2614  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177274  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0345  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3758  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0279178  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3465  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155512  normal  0.071059 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3050  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0897802  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0332  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00936849  decreased coverage  0.00323406 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2741  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0301719  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  53.06 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0285  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104363  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0366  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139804  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0737  50S ribosomal protein L30  47.06 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000491198  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0391  50S ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000847959  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0399  50S ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3151  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0153482  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  53.06 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1942  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3728  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00881974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3786  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3496  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0294  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000487608  normal  0.0630356 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0267  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.16996  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3931  50S ribosomal protein L30  50.98 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  46.15 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1040  50S ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2307  50S ribosomal protein L30  46.94 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.227659  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0619  50S ribosomal protein L30  46.94 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.268532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4258  ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 61 aa  53.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000321281  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0493  50S ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  50 
 
 		 61 aa  52.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3425  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5052  50S ribosomal protein L30  46.94 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0338  50S ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0500477  hitchhiker  0.00104601 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4225  ribosomal protein L30  44.9 
 
 		 60 aa  51.6  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00829354  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0785  ribosomal protein L30  46 
 
 		 62 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000912341  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06430  50S ribosomal protein L30  46 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340792  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  44.23 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  47.92 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  40.82 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2696  50S ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2381  50S ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4672  ribosomal protein L30  44 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000104117  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00956  50S ribosomal protein L30  43.75 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0648954  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  44.23 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  40.82 
 
 		 58 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  40 
 
 		 61 aa  48.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0423  50S ribosomal protein L30  48 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.60192  normal  0.209018 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  38 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0249  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4152  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000726837  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3741  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000717278  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4038  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000117775  unclonable  0.00000000000200607 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0214  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000115518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0218  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000314653  hitchhiker  0.0000935583 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  38 
 
 		 59 aa  47.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 62 aa  47  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5061  50S ribosomal protein L30  38 
 
 		 58 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000009319  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0341  ribosomal protein L30  41.18 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000260811  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0297  50S ribosomal protein L30P  44.23 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000000859668  hitchhiker  0.00000207421 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09030  50S ribosomal protein L30  42 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0258453  normal  0.264293 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0855  50S ribosomal protein L30  42 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.342105  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0515  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181031  unclonable  0.0000000000137591 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  38 
 
 		 58 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0345  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  36 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1929  50S ribosomal protein L30  46 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.630046 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  38 
 
 		 58 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0726  ribosomal protein L30  39.22 
 
 		 57 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0489347  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3649  50S ribosomal protein L30  37.74 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000866459  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0644  ribosomal protein L30  38 
 
 		 58 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104733  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4530  50S ribosomal protein L30  38 
 
 		 58 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0070404  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1928  50S ribosomal protein L30  46 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1951  50S ribosomal protein L30  46 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  46 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2036  50S ribosomal protein L30  46 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0416  ribosomal protein L30  38 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4731  50S ribosomal protein L30  38 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000152085  normal  0.600234 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  46 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0313  ribosomal protein L30  43.14 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00845621  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0188  50S ribosomal protein L30  38.78 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158011  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1007  50S ribosomal protein L30  37.5 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00128687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  41.51 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  41.51 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  44 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0502  50S ribosomal protein L30  36 
 
 		 58 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000122641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>