More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0417 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
120 aa  248  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  91.09 
 
 
106 aa  191  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  74.76 
 
 
104 aa  165  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  62.89 
 
 
102 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  56.48 
 
 
110 aa  123  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  50 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  55.17 
 
 
107 aa  103  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 
105 aa  89.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  43.82 
 
 
113 aa  86.3  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  48 
 
 
94 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  48 
 
 
94 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  48.61 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
125 aa  77  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  44.05 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 
115 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  44.87 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
111 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
111 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  48.57 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  47.89 
 
 
95 aa  72  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  51.56 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
327 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
90 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
342 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  47.89 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  38.82 
 
 
349 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 
354 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  42.05 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  42.05 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  46.48 
 
 
95 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  41.46 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  46.48 
 
 
95 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  43.84 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0684  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 
115 aa  70.1  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  42.5 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  42.5 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  41.18 
 
 
92 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  47.37 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  43.08 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 
328 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1731  arsenical resistance operon repressor  41.05 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0861085  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
317 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0666  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.25 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  41.25 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0567  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  34.88 
 
 
120 aa  67  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  46.48 
 
 
97 aa  67  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
127 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  42.25 
 
 
108 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  43.59 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  44.78 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  40.58 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  40.91 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  38.96 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1033  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  38.96 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  38.96 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  38.96 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  38.96 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.25 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  38.96 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  38.96 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.25 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
106 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 
307 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.77 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.77 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  41.77 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.77 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  42.31 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  34.18 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>