163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4237 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4237  lysophospholipase-like protein  100 
 
 		 313 aa  632  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48400  hypothetical protein  70.29 
 
 		 312 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00598917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0401  hypothetical protein  70.93 
 
 		 313 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04030  hypothetical protein  69.97 
 
 		 339 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5214  lipase  64.01 
 
 		 308 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0304  lipase  63.69 
 
 		 308 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5299  hypothetical protein  61.08 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19517  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5161  hypothetical protein  61.78 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.382535 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5068  lysophospholipase-like protein  61.78 
 
 		 328 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5393  hypothetical protein  58.28 
 
 		 316 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4857  hypothetical protein  61.15 
 
 		 313 aa  358  5e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.694232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3155  alpha/beta hydrolase  45.86 
 
 		 332 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.200614  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2822  alpha/beta hydrolase fold  40.38 
 
 		 329 aa  235  9e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.463464  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3471  hypothetical protein  38.2 
 
 		 346 aa  199  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00814708  normal  0.0128329 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 		 278 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  28.38 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  28.1 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  24.08 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 289 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3641  lysophospholipase  24.25 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  31.29 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  26.01 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  25.84 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2037  hypothetical protein  33.86 
 
 		 505 aa  60.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0462564  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  27.21 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 		 559 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  32.56 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  32.56 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  32.56 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  36.04 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1042  hypothetical protein  33.9 
 
 		 487 aa  57  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0894672 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  23.33 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0124  hypothetical protein  29.77 
 
 		 482 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.962224 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  36.46 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 254 aa  55.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5395  hypothetical protein  28.33 
 
 		 541 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.407079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1563  alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  27.06 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  34.56 
 
 		 303 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  36.97 
 
 		 289 aa  53.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  34.56 
 
 		 303 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  28.57 
 
 		 288 aa  52.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1469  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 		 254 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0985  putative lipoprotein  26.8 
 
 		 397 aa  52.8  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0015  hypothetical protein  29.82 
 
 		 493 aa  52.4  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  35.04 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  25.79 
 
 		 265 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  32.92 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  32.92 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  35.04 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  27.87 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1974  alpha/beta hydrolase fold protein  30.06 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826576  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  35.04 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  35.04 
 
 		 280 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  35.04 
 
 		 280 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4082  hypothetical protein  29.37 
 
 		 487 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4134  hypothetical protein  29.37 
 
 		 487 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0079  hypothetical protein  29.37 
 
 		 487 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 250 aa  50.8  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3878  alpha/beta hydrolase fold protein  25.82 
 
 		 345 aa  50.4  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31752 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  27.19 
 
 		 272 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  27.19 
 
 		 277 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  34.55 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0114  hypothetical protein  27.49 
 
 		 453 aa  49.7  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  27.19 
 
 		 267 aa  49.7  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0620  hypothetical protein  29.63 
 
 		 487 aa  49.7  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5009  hypothetical protein  27.19 
 
 		 267 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 		 320 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4878  hypothetical protein  27.19 
 
 		 267 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  27.19 
 
 		 267 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  27.19 
 
 		 267 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  27.4 
 
 		 279 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 267 aa  49.3  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 		 320 aa  49.3  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4869  hypothetical protein  27.19 
 
 		 267 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3537  hydrolase  25.48 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.297749  normal  0.0703626 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  29.55 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1660  lysophospholipase  26.11 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.631285  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1229  hypothetical protein  28.81 
 
 		 491 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  25.44 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>