More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3640 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3640  nitroreductase  100 
 
 		 245 aa  498  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  39.43 
 
 		 265 aa  201  7e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  40.27 
 
 		 270 aa  194  7e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  40.27 
 
 		 270 aa  194  8.000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0456  nitroreductase  34.47 
 
 		 240 aa  142  6e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1678  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  35.62 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.244515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05892  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  32.05 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0821  putative NADPH nitroreductase protein  30.13 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  29.96 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  29.18 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  29.26 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1805  nitroreductase  23.58 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000108045  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  27.43 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  23.56 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  29.47 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  27.66 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  27.31 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  24.03 
 
 		 212 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  27.01 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1322  nitroreductase  26.11 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  25.53 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  24.64 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  26.34 
 
 		 202 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47329  predicted protein  29.83 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  21.88 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  24.39 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  24.77 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  24.02 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  26.6 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  24.77 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  23.25 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  23.18 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  23.61 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  23.61 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  23.71 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  28.85 
 
 		 201 aa  68.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  25.74 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  23.18 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  23.25 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1846  nitroreductase  24.67 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  43.16 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  23.77 
 
 		 207 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  23.77 
 
 		 207 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  23.77 
 
 		 207 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  23.77 
 
 		 207 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  22.32 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  27.32 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  23.19 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  34.69 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1071  nitroreductase  22.87 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  28.38 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1220  nitroreductase family protein  24.77 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.168432  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  34.69 
 
 		 166 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  26.32 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68560  putative nitroreductase  26.83 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  22.97 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  24.79 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  21.46 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  25.23 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  26.29 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4065  nitroreductase family protein  24.34 
 
 		 205 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960529 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4112  nitroreductase family protein  23.89 
 
 		 205 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662244  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  24.34 
 
 		 205 aa  62  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  24.34 
 
 		 205 aa  62  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  26.44 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  24.34 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  24.58 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  25.21 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  26.1 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  27.83 
 
 		 185 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  25.23 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  26.34 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  27.44 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  36 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  25.57 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  25.22 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  25.23 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3786  nitroreductase family protein  23.89 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.776099  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  24.78 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4176  nitroreductase family protein  23.89 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113273  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4154  nitroreductase family protein  23.45 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  27.6 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1084  nitroreductase family protein  23.45 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  40.74 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  26.96 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  22.95 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  41.56 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  25.99 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1405  nitroreductase  25.36 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  24.66 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  23.58 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  21.08 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  24.66 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  24.66 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  25.88 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  23.66 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  25.34 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  24.66 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  24.66 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  24.89 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>