More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2203 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2203  ABC transporter related  100 
 
 		 567 aa  1120    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  47.79 
 
 		 596 aa  502  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0712  ABC transporter related  37.9 
 
 		 596 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0247864  normal  0.335635 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7111  ABC transporter related  37.43 
 
 		 596 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483113  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6143  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.16 
 
 		 603 aa  361  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  37.1 
 
 		 599 aa  356  6.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0591  ABC transporter related  37.54 
 
 		 593 aa  356  6.999999999999999e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179629 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2875  ABC transporter related  37.23 
 
 		 625 aa  353  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216771  normal  0.111784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0553  ABC transporter related  38.87 
 
 		 598 aa  351  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1248  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  37.41 
 
 		 625 aa  350  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6186  multidrug ABC transporter ATPase/permease  38.13 
 
 		 605 aa  348  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  35.12 
 
 		 601 aa  346  5e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  35.88 
 
 		 600 aa  346  7e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  35.99 
 
 		 620 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  35.99 
 
 		 620 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  35.99 
 
 		 620 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2182  ABC transporter related  35.63 
 
 		 600 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4093  ABC transporter related  38.24 
 
 		 585 aa  339  9e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4941  ABC transporter related  35.11 
 
 		 604 aa  339  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.690923  normal  0.361162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  37.16 
 
 		 595 aa  336  7e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2299  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  35.64 
 
 		 620 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  35.71 
 
 		 572 aa  331  3e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3687  ABC transporter related  35.28 
 
 		 620 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5523  ABC transporter related  35.15 
 
 		 620 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4939  ABC transporter related  38.16 
 
 		 626 aa  325  9e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3039  ABC transporter related  36.65 
 
 		 595 aa  325  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5449  ABC transporter related  37.35 
 
 		 622 aa  323  6e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89957  normal  0.0448259 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3418  ABC transporter related  39.32 
 
 		 595 aa  322  8e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  normal  0.0149825 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  36.53 
 
 		 581 aa  318  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0515  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  35.39 
 
 		 663 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1637  ABC transporter related  37.26 
 
 		 630 aa  306  5.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135005  normal  0.475393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3233  ABC transporter related  33.04 
 
 		 599 aa  306  7e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2524  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.16 
 
 		 669 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265455  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2665  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  36.16 
 
 		 669 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0953  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  36.16 
 
 		 669 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0233  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  35.78 
 
 		 669 aa  299  9e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1612  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  35.78 
 
 		 669 aa  299  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658136  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0270  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.78 
 
 		 669 aa  299  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1416  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.78 
 
 		 669 aa  299  9e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5858  ABC transporter related  30.43 
 
 		 591 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1912  ABC transporter related  33.89 
 
 		 604 aa  263  4.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1898  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  39.41 
 
 		 610 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0761429  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.55 
 
 		 609 aa  249  9e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.55 
 
 		 591 aa  249  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1441  ABC transporter related  39.64 
 
 		 618 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.51 
 
 		 579 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  34.93 
 
 		 612 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  33.51 
 
 		 591 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  32.55 
 
 		 609 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  34.93 
 
 		 612 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  36.17 
 
 		 624 aa  243  5e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00688  multidrug resistance ABC transporter ATP-binding and permease protein  36.91 
 
 		 613 aa  243  6e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0450616  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2340  ABC transporter related  33.4 
 
 		 604 aa  243  7.999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.502377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3836  ABC transporter related  34.5 
 
 		 610 aa  243  9e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.643944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22440  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  38.82 
 
 		 610 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4049  ABC transporter related  34.3 
 
 		 610 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2892  ABC transporter related  36.79 
 
 		 612 aa  242  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1783  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.86 
 
 		 588 aa  240  5e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1348  ABC transporter related  34.3 
 
 		 610 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416951  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.18 
 
 		 598 aa  239  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  33.09 
 
 		 619 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6225  ABC transporter related  39.95 
 
 		 624 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0242  ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 		 706 aa  236  6e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  32.59 
 
 		 606 aa  236  8e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  34.46 
 
 		 617 aa  236  9e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0957  hypothetical protein  37.23 
 
 		 593 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6620  ABC transporter related  37.8 
 
 		 617 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.349027  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  35.33 
 
 		 613 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  32.15 
 
 		 590 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1782  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.33 
 
 		 588 aa  235  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.24 
 
 		 575 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2135  ABC transporter-related protein  37.96 
 
 		 630 aa  235  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180328 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3490  ATPase  36.27 
 
 		 614 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  35.98 
 
 		 611 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04517  ABC heavy metal ion transporter (Eurofung)  31.08 
 
 		 920 aa  234  4.0000000000000004e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0665  ABC transporter related  37.1 
 
 		 646 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.308501 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4542  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.91 
 
 		 610 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0677  ABC transporter related  37.1 
 
 		 618 aa  234  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.0281361 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.57 
 
 		 600 aa  233  6e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2631  ABC transporter related  35.38 
 
 		 608 aa  233  7.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478405  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.73 
 
 		 595 aa  233  8.000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1204  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  35.09 
 
 		 614 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494984  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  32.67 
 
 		 592 aa  233  9e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1765  putative multidrug export ATP-binding/permease protein  34.14 
 
 		 611 aa  233  9e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.193785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7080  ABC transporter related  36.99 
 
 		 621 aa  232  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.161763  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.84 
 
 		 600 aa  233  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1868  ABC transporter related  33.47 
 
 		 610 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0083  ABC transporter related  38.9 
 
 		 619 aa  231  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2865  ABC transporter related  34.58 
 
 		 614 aa  232  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.148905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6140  ABC transporter related  37.53 
 
 		 617 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  31.97 
 
 		 643 aa  231  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7674  ABC efflux pump, ATPase subunit  33.89 
 
 		 617 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.131905 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  33.86 
 
 		 468 aa  231  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5775  ABC transporter related  37.53 
 
 		 617 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.832359  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0731  hypothetical protein  30.42 
 
 		 582 aa  230  5e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  32.73 
 
 		 612 aa  230  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0108  ABC transporter related  35.52 
 
 		 636 aa  230  6e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.366198  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4091  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.59 
 
 		 610 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0803284  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  36.54 
 
 		 617 aa  230  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001285  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  37.7 
 
 		 603 aa  229  7e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000363731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>