63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3319 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3319  Uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  100 
 
 		 1120 aa  2273    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  26.36 
 
 		 897 aa  75.5  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0816  Ycf48-like protein  32.31 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  33.6 
 
 		 338 aa  64.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1662  Ycf48-like protein  33.6 
 
 		 338 aa  63.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243445  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  26.4 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  23.43 
 
 		 344 aa  61.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1238  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 340 aa  60.1  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1856  Ycf48-like protein  33.33 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  31.16 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  31.16 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03191  Ycf48-like protein  29.51 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  24.69 
 
 		 343 aa  57.4  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03201  Ycf48-like protein  29.84 
 
 		 338 aa  57.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0298  Ycf48-like protein  29.84 
 
 		 338 aa  56.2  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1624  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1054 aa  55.1  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6016 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  34.21 
 
 		 363 aa  53.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03221  Ycf48-like protein  30.16 
 
 		 339 aa  52.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04110  putative membrane associated hydrolase  26.79 
 
 		 877 aa  52  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.290625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  25.63 
 
 		 742 aa  50.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.33 
 
 		 334 aa  50.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  32.19 
 
 		 320 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  28.37 
 
 		 319 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3503  Ycf48-like protein  30.4 
 
 		 337 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  39.44 
 
 		 299 aa  50.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  27.61 
 
 		 341 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  27.54 
 
 		 346 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  25.48 
 
 		 365 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  30.23 
 
 		 333 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 341 aa  49.7  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  31.03 
 
 		 336 aa  50.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  28 
 
 		 361 aa  48.9  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0253  secreted protein containing glycosyl hydrolase BNR repeats  30.25 
 
 		 348 aa  48.9  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0299719  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  30.5 
 
 		 353 aa  48.5  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2442  BNR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 338 aa  48.9  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03291  Ycf48-like protein  28.8 
 
 		 337 aa  48.5  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.307197  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2223  BNR repeat-containing protein  22.13 
 
 		 336 aa  48.5  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110156  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  22.96 
 
 		 329 aa  48.5  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  23.44 
 
 		 361 aa  48.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.72 
 
 		 314 aa  47.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  25.65 
 
 		 324 aa  48.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2555  BNR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 338 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0401334  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3885  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.56 
 
 		 1465 aa  47  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0646  hypothetical protein  25.7 
 
 		 363 aa  47  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0104627  normal  0.241315 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  25.47 
 
 		 323 aa  46.2  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  26.23 
 
 		 338 aa  46.2  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  24.67 
 
 		 363 aa  46.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.66 
 
 		 323 aa  46.2  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  29.57 
 
 		 342 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1570  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 1021 aa  46.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371729 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.47 
 
 		 323 aa  46.2  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1178  Ycf48-like protein  26.77 
 
 		 349 aa  45.8  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1569  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 1063 aa  46.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1054  hypothetical protein  29.05 
 
 		 873 aa  46.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  24.23 
 
 		 421 aa  45.8  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2435  BNR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 338 aa  45.4  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.724955  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25281  Ycf48-like protein  29.13 
 
 		 335 aa  45.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3373  oxidoreductase  29.1 
 
 		 372 aa  45.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  25.87 
 
 		 1083 aa  45.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_007513  Syncc9902_0228  Ycf48-like protein  29.13 
 
 		 333 aa  45.4  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.34 
 
 		 342 aa  44.7  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1574  glycosyl hydrolase, BNR repeat-containing protein  20.61 
 
 		 999 aa  44.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0267092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.14 
 
 		 359 aa  44.7  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>