111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2411 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 		 271 aa  547  1e-155  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1772  Ion transport 2 domain-containing protein  29.84 
 
 		 211 aa  94.7  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  29.91 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1233  hypothetical protein  37.88 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0271776 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0647  ion transport family protein  40.68 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  37.8 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  37.01 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0413  Ion transport 2 domain-containing protein  31.41 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  36.75 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0500  Ion transport 2 domain protein  38.52 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0517  Ion transport 2 domain protein  38.52 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000756398  decreased coverage  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5186  putative Voltage-gated potassium channel  26.03 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.240486 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1907  putative ion channel  36.28 
 
 		 220 aa  78.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  32.62 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1808  Ion transport 2 domain-containing protein  34.47 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0516361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2482  Ion transport 2 domain protein  34.51 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.745368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1842  Ion transport 2 domain-containing protein  40.83 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2018  Ion transport 2 domain protein  36.84 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2859  Ion transport 2 domain protein  31.58 
 
 		 219 aa  72  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3734  hypothetical protein  35.54 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1459  Ion transport 2 domain-containing protein  32.85 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209929 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1489  Ion transport 2 domain protein  24.2 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670111  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2231  Ion transport 2 domain protein  31.03 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338612 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22810  hypothetical protein  32.5 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19221  hypothetical protein  32.39 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1485  hypothetical protein  28.8 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54680  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238288  hitchhiker  0.00000298461 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4778  hypothetical protein  50 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0839  ion transport 2 domain-containing protein  35.79 
 
 		 327 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0749  Ion transport 2 domain protein  29.27 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0175  Ion transport 2 domain-containing protein  33.8 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.733026  normal  0.37729 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  27.96 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  40.35 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0186  Ion transport 2  33.8 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.877923  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2879  uncharacterized low-complexity protein  51.11 
 
 		 327 aa  50.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0195  Ion transport 2 domain-containing protein  33.8 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  31.08 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0938  Ion transport 2 domain-containing protein  48.89 
 
 		 327 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  34.78 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  37.1 
 
 		 302 aa  49.7  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  32.84 
 
 		 269 aa  49.3  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0810  ion transport 2 domain-containing protein  48.89 
 
 		 326 aa  48.9  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  32.5 
 
 		 256 aa  48.9  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  27.46 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  26.37 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1320  Ion transport 2 domain protein  42.22 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  36.07 
 
 		 405 aa  47.4  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  35.09 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  42 
 
 		 509 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0923  hypothetical protein  26.32 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.581577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  37.5 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0760  Ion transport 2 domain protein  31.75 
 
 		 224 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400355  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0755  Ion transport 2 domain-containing protein  47.73 
 
 		 330 aa  46.2  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  38.6 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  29.41 
 
 		 517 aa  45.8  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1372  Ion transport 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 268 aa  45.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  29.69 
 
 		 419 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0960  Ion transport 2 domain-containing protein  29.46 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  31.65 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31186  outward-rectifier potassium channel  39.66 
 
 		 700 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000798921  normal  0.515447 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0050  Ion transport 2 domain protein  46.3 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  44.23 
 
 		 438 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  44.23 
 
 		 408 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  34.85 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 408 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2113  K+ channel, inward rectifier  38 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  24.54 
 
 		 367 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  34.29 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  29.13 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  29.13 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  34.85 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  34.85 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  29.13 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  34.85 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  29.63 
 
 		 385 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  39.22 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  34.85 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  37.5 
 
 		 393 aa  43.9  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  34.85 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  34.85 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0673  potassium channel protein  37.7 
 
 		 428 aa  43.9  0.003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0468102  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  37.04 
 
 		 531 aa  43.9  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  51.35 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  33.33 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  31.82 
 
 		 430 aa  43.5  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  26.04 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  25 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  35.82 
 
 		 364 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  35.82 
 
 		 364 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  38.1 
 
 		 366 aa  43.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  26.45 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  33.33 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  33.63 
 
 		 159 aa  42.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  35.82 
 
 		 364 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  46.88 
 
 		 356 aa  42.7  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  32.88 
 
 		 265 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  34.94 
 
 		 279 aa  42.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2957  Ion transport 2 domain protein  32.53 
 
 		 190 aa  42.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00024289  hitchhiker  0.0035902 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  37.25 
 
 		 273 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>