56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1761 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1761  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 		 319 aa  651    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0166  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.77 
 
 		 390 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1279  putative membrane-associated zinc metallopeptidase  37.21 
 
 		 456 aa  50.8  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.253686  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  34.94 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  35.9 
 
 		 505 aa  49.3  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.33 
 
 		 347 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.81 
 
 		 347 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  29.73 
 
 		 512 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35 
 
 		 384 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  34.74 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4739  carboxyl-terminal protease  28.39 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5068  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 416 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.53 
 
 		 471 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1464  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  34.21 
 
 		 360 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.29 
 
 		 442 aa  47  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1444  PDZ/DHR/GLGF domain protein  40.32 
 
 		 379 aa  46.6  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  29.11 
 
 		 453 aa  46.6  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  44.07 
 
 		 454 aa  45.8  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.3 
 
 		 387 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.7 
 
 		 357 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0632  peptidase M50  46.67 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0104  periplasmic serine protease DO  34.15 
 
 		 474 aa  44.7  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  34.78 
 
 		 434 aa  45.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  36.51 
 
 		 443 aa  44.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  28.57 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1049  DegS serine peptidase  35.59 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0146114  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.94 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  36.49 
 
 		 489 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.48 
 
 		 386 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  38.46 
 
 		 442 aa  43.9  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  31.94 
 
 		 409 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  32.26 
 
 		 379 aa  43.5  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 415 aa  43.5  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.33 
 
 		 412 aa  43.5  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  32.98 
 
 		 389 aa  43.9  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  25.35 
 
 		 392 aa  43.5  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3272  DegS serine peptidase  32.53 
 
 		 360 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581371  hitchhiker  0.00106456 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  30.67 
 
 		 435 aa  43.9  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.48 
 
 		 388 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.1 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.26 
 
 		 379 aa  43.5  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  41.79 
 
 		 561 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  32.26 
 
 		 389 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0386  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.33 
 
 		 484 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  34.33 
 
 		 831 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  32.26 
 
 		 389 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2658  PDZ/DHR/GLGF:ankyrin  35.19 
 
 		 1003 aa  42.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1435  peptidase S1C, Do  29.01 
 
 		 545 aa  43.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.600827 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3020  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  36.21 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0574  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  39.39 
 
 		 417 aa  42.7  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30609  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  35.62 
 
 		 539 aa  42.7  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000345024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  28.41 
 
 		 452 aa  42.7  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  31.43 
 
 		 506 aa  42.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  31.94 
 
 		 459 aa  42.4  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  31.94 
 
 		 459 aa  42.4  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>