More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1648 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1648  ABC transporter related protein  100 
 
 		 594 aa  1225    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.372378  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0334  ABC transporter related protein  37.77 
 
 		 606 aa  436  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136705  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  33.12 
 
 		 635 aa  334  2e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  33.28 
 
 		 630 aa  332  9e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  34.3 
 
 		 644 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 		 644 aa  325  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  34.67 
 
 		 640 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  31.73 
 
 		 643 aa  323  7e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  33.03 
 
 		 639 aa  323  7e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  34.52 
 
 		 658 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  34.31 
 
 		 662 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  34.52 
 
 		 658 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  37.06 
 
 		 641 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  34.52 
 
 		 658 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  34.52 
 
 		 658 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  35.29 
 
 		 644 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  34.05 
 
 		 659 aa  320  6e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  33 
 
 		 659 aa  318  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  34.65 
 
 		 659 aa  317  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  33.33 
 
 		 658 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  33.22 
 
 		 637 aa  313  4.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  31.84 
 
 		 690 aa  310  4e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  30.48 
 
 		 645 aa  310  5e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  33.59 
 
 		 528 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  32.71 
 
 		 636 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  31.35 
 
 		 643 aa  305  1.0000000000000001e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  30.8 
 
 		 672 aa  303  5.000000000000001e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  32.91 
 
 		 636 aa  303  7.000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0143  ABC transporter-related protein  33.22 
 
 		 611 aa  300  5e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.565871  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1170  ABC transporter related protein  32.92 
 
 		 610 aa  300  6e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  32.14 
 
 		 668 aa  300  6e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2936  ABC transporter ATP-binding protein  32.7 
 
 		 528 aa  299  9e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.914866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  36.13 
 
 		 619 aa  298  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2755  ABC transporter related  32.51 
 
 		 528 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  33.76 
 
 		 542 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0127  ABC transporter, ATP-binding protein  32.7 
 
 		 546 aa  297  3e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2836  ABC transporter related  32.51 
 
 		 528 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104102  normal  0.187196 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28710  ABC transporter, ATP binding component  33.27 
 
 		 521 aa  297  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2750  ABC transporter related  32.51 
 
 		 528 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.742675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2882  ABC transporter related  33.14 
 
 		 528 aa  297  4e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  34.99 
 
 		 540 aa  296  5e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2766  ABC transporter, ATP-binding protein  33.4 
 
 		 521 aa  296  6e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0491169  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  32.37 
 
 		 642 aa  296  6e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  32.37 
 
 		 642 aa  296  6e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2495  ABC transporter  32.76 
 
 		 529 aa  296  7e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4782  ABC transporter related  32.7 
 
 		 620 aa  294  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  30.8 
 
 		 638 aa  294  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  33.88 
 
 		 549 aa  293  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  32.22 
 
 		 621 aa  293  5e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  32.22 
 
 		 621 aa  293  7e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2609  ABC transporter-like  31.81 
 
 		 528 aa  293  9e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.65 
 
 		 639 aa  293  9e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  30.84 
 
 		 643 aa  292  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2480  ABC transporter related  32 
 
 		 529 aa  292  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  32.23 
 
 		 627 aa  291  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  30.71 
 
 		 633 aa  291  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  34.32 
 
 		 540 aa  291  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  34.26 
 
 		 544 aa  291  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3332  ABC transporter ATP-binding protein  31.68 
 
 		 529 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  29.88 
 
 		 709 aa  290  3e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.09 
 
 		 637 aa  291  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  34.13 
 
 		 540 aa  291  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39130  putative ATP-binding component of ABC transporter  32.3 
 
 		 521 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.288914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  33.21 
 
 		 543 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  30.62 
 
 		 663 aa  290  6e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  34.62 
 
 		 545 aa  290  6e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  33.76 
 
 		 560 aa  289  8e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  31.66 
 
 		 627 aa  289  9e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0061  ABC transporter related  30.9 
 
 		 635 aa  288  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.234701 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  31.42 
 
 		 656 aa  289  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  34.01 
 
 		 540 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  33.46 
 
 		 543 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  31.08 
 
 		 663 aa  288  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  34.81 
 
 		 540 aa  288  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  34.95 
 
 		 540 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  35.96 
 
 		 575 aa  288  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 545 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  31.53 
 
 		 646 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1575  ABC transporter-related protein  31.09 
 
 		 540 aa  287  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.830365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  35.51 
 
 		 540 aa  287  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  34.38 
 
 		 540 aa  286  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  34.26 
 
 		 540 aa  286  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  34.38 
 
 		 540 aa  286  5e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  34.69 
 
 		 540 aa  287  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  31.72 
 
 		 685 aa  287  5e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0911  ABC transporter ATP-binding protein  31.13 
 
 		 523 aa  286  7e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.7 
 
 		 541 aa  286  9e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0972  ABC transporter related  31.94 
 
 		 626 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066159 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  34.13 
 
 		 565 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1127  ABC transporter, ATP-binding protein  31.1 
 
 		 530 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.66 
 
 		 645 aa  285  2.0000000000000002e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  34.07 
 
 		 540 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  34.74 
 
 		 540 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003501  ABC transporter ATP-binding protein  31.06 
 
 		 530 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2535  ABC transporter related  30.3 
 
 		 530 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.776559  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.94 
 
 		 637 aa  284  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  30.17 
 
 		 627 aa  284  4.0000000000000003e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  34.81 
 
 		 540 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  34.25 
 
 		 540 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1844  ABC transporter related  31.27 
 
 		 540 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>