More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1700 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
798 aa  1641    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
778 aa  251  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.25 
 
 
774 aa  246  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.01 
 
 
389 aa  242  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.63 
 
 
784 aa  242  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.01 
 
 
617 aa  241  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.22 
 
 
717 aa  240  9e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.9 
 
 
512 aa  239  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.82 
 
 
513 aa  238  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.12 
 
 
511 aa  238  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.94 
 
 
772 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 
502 aa  237  6e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.81 
 
 
600 aa  237  6e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.52 
 
 
511 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  48.43 
 
 
513 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  51.56 
 
 
771 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  48.43 
 
 
513 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  48.56 
 
 
532 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51 
 
 
769 aa  235  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  50 
 
 
783 aa  234  4.0000000000000004e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.15 
 
 
530 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  50 
 
 
783 aa  234  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  47.93 
 
 
513 aa  234  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.15 
 
 
531 aa  234  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.04 
 
 
911 aa  234  7.000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.43 
 
 
769 aa  232  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  50.78 
 
 
771 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.74 
 
 
530 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  51.91 
 
 
779 aa  230  6e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  45.82 
 
 
773 aa  231  6e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.43 
 
 
769 aa  230  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.7 
 
 
523 aa  230  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.15 
 
 
533 aa  230  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.34 
 
 
844 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  48.15 
 
 
536 aa  229  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.24 
 
 
1276 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  48.06 
 
 
790 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.86 
 
 
775 aa  229  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.15 
 
 
536 aa  228  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  46.12 
 
 
511 aa  228  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  46.33 
 
 
620 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 
770 aa  226  9e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  45.14 
 
 
773 aa  226  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.84 
 
 
1296 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
518 aa  225  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  49.4 
 
 
774 aa  225  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.22 
 
 
1192 aa  225  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.19 
 
 
511 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  44.19 
 
 
511 aa  224  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.82 
 
 
1138 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.36 
 
 
505 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  44.44 
 
 
1410 aa  223  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 
594 aa  221  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  45.16 
 
 
288 aa  221  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  45.1 
 
 
470 aa  220  8.999999999999998e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.49 
 
 
775 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.87 
 
 
377 aa  218  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  40.15 
 
 
1035 aa  215  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.85 
 
 
509 aa  215  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3481  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.67 
 
 
704 aa  214  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.112139 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.16 
 
 
797 aa  213  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  42.75 
 
 
470 aa  213  1e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.19 
 
 
764 aa  212  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.13 
 
 
782 aa  211  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  30.81 
 
 
1131 aa  210  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1549  sensory box histidine kinase  39.77 
 
 
1035 aa  210  8e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.62 
 
 
661 aa  209  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3923  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 
1055 aa  209  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 
836 aa  208  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 
468 aa  208  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0543  PAS sensor protein  46.12 
 
 
786 aa  207  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0831512  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.69 
 
 
786 aa  206  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 
969 aa  205  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299525  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0316  response regulator, histidine kinase  40.27 
 
 
891 aa  205  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 
456 aa  205  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.8 
 
 
562 aa  204  6e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.69 
 
 
786 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 
587 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 
1000 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420098  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  41.73 
 
 
508 aa  202  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  43.92 
 
 
910 aa  201  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.7 
 
 
2213 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 
795 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.46 
 
 
1274 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 
583 aa  198  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  42.46 
 
 
503 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
568 aa  197  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 
605 aa  197  6e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 
513 aa  196  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 
614 aa  195  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 
754 aa  194  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 
1352 aa  194  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 
579 aa  194  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 
977 aa  194  8e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.74 
 
 
1313 aa  193  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 
763 aa  193  9e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 
395 aa  193  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  43.67 
 
 
525 aa  193  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  40.79 
 
 
629 aa  192  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 
371 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>