33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0103 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0103  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  335  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1359  hypothetical protein  31.34 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2139  hypothetical protein  28.99 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0442  hypothetical protein  33.61 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2140  hypothetical protein  29.63 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1076  hypothetical protein  28.77 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0379  hypothetical protein  32.89 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1605  hypothetical protein  39.29 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1077  hypothetical protein  24.83 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  27.61 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3073  hypothetical protein  35.48 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.590013  normal  0.400925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  26.87 
 
 		 223 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1724  hypothetical protein  25.2 
 
 		 209 aa  52  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1681  hypothetical protein  27.46 
 
 		 186 aa  51.6  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0467098  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3746  hypothetical protein  28.47 
 
 		 182 aa  50.8  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0768901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0930  hypothetical protein  28.15 
 
 		 216 aa  50.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.432355 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2151  hypothetical protein  29.27 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0990519  normal  0.164648 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1268  hypothetical protein  29.45 
 
 		 315 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0872  hypothetical protein  29.2 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3899  protein of unknown function DUF1457  29.21 
 
 		 189 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3935  hypothetical protein  29.86 
 
 		 252 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1527  hypothetical protein  34.78 
 
 		 245 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173239  normal  0.19078 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1076  hypothetical protein  38.71 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00643993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3273  hypothetical protein  25.62 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00114404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2534  protein of unknown function DUF1457  32.1 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2259  hypothetical protein  32.1 
 
 		 248 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0461584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3233  hypothetical protein  38.57 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2216  protein of unknown function DUF1457  35.21 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.196388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1854  protein of unknown function DUF1457  23.57 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142291  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2054  protein of unknown function DUF1457  22.73 
 
 		 205 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5216  hypothetical protein  26.4 
 
 		 185 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  25 
 
 		 184 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5126  protein of unknown function DUF1457  31.65 
 
 		 197 aa  40.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>