More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2596 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2596  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 362 aa  745    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2588  branched-chain amino acid aminotransferase  51.83 
 
 		 354 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000807633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3098  branched-chain amino acid aminotransferase  51.26 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0656  branched-chain amino acid aminotransferase  51.26 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2144  branched-chain amino acid aminotransferase  54.05 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2853  branched-chain amino acid aminotransferase  52.85 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000542483  hitchhiker  0.0000000111677 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3951  branched-chain amino acid aminotransferase  51.05 
 
 		 357 aa  363  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000422235  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  52.1 
 
 		 357 aa  360  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.467391  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2638  branched-chain amino acid aminotransferase  48.88 
 
 		 359 aa  359  4e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000340961  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0572  branched-chain amino acid aminotransferase  50.7 
 
 		 356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000149445  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3543  branched-chain amino acid aminotransferase  50.74 
 
 		 367 aa  353  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417874  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0585  branched-chain amino acid aminotransferase  51.65 
 
 		 356 aa  352  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279686 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0591  branched-chain amino acid aminotransferase  50.14 
 
 		 358 aa  351  8.999999999999999e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0577  branched-chain amino acid aminotransferase  50.14 
 
 		 358 aa  351  8.999999999999999e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0856  branched chain amino acid aminotransferase  48.86 
 
 		 356 aa  344  2e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2663  branched-chain amino acid aminotransferase  49.4 
 
 		 353 aa  341  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.741695  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0195  branched-chain amino acid aminotransferase  50.91 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3069  branched-chain amino acid aminotransferase  47.59 
 
 		 371 aa  340  2e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.702338  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  47.18 
 
 		 356 aa  339  5e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.335464  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0616  branched-chain amino acid aminotransferase  47.69 
 
 		 373 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7786  branched-chain amino acid aminotransferase  46.69 
 
 		 365 aa  336  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0537  branched-chain amino acid aminotransferase  48.53 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2811  branched-chain amino acid aminotransferase  46.2 
 
 		 363 aa  330  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.642497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1524  branched-chain amino acid aminotransferase  46.02 
 
 		 367 aa  328  7e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8041  branched-chain amino acid aminotransferase  48.21 
 
 		 364 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0176  branched-chain amino acid aminotransferase  45.38 
 
 		 371 aa  325  7e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2671  branched-chain amino acid aminotransferase  45.11 
 
 		 367 aa  325  1e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4107  branched-chain amino acid aminotransferase  45.43 
 
 		 366 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.456695 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  45.43 
 
 		 366 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04566  branched-chain amino acid aminotransferase  47.41 
 
 		 359 aa  323  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12238  branched-chain amino acid aminotransferase  46.05 
 
 		 368 aa  323  4e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127743  normal  0.533205 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0708  branched-chain amino acid aminotransferase  46.26 
 
 		 364 aa  322  5e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1388  branched-chain amino acid aminotransferase  47.7 
 
 		 370 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632887  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0975  branched-chain amino acid aminotransferase  48.48 
 
 		 362 aa  322  6e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.568362  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0726  branched-chain amino acid aminotransferase  46.42 
 
 		 364 aa  321  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.275399 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  47.18 
 
 		 367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10560  branched chain amino acid aminotransferase  48.66 
 
 		 367 aa  320  3e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.114756 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4175  branched-chain amino acid aminotransferase  47.7 
 
 		 371 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0857  branched-chain amino acid aminotransferase  48.18 
 
 		 362 aa  320  3e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2919  branched chain amino acid aminotransferase  45.07 
 
 		 366 aa  320  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742816  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2940  branched-chain amino acid aminotransferase  46.59 
 
 		 367 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3573  branched-chain amino acid aminotransferase  46.88 
 
 		 367 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0805126  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1703  branched-chain amino acid aminotransferase  44.83 
 
 		 375 aa  317  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0434544 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3367  branched chain amino acid aminotransferase  45.81 
 
 		 357 aa  317  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215737  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3886  branched-chain amino acid aminotransferase  46.99 
 
 		 370 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2520  branched-chain amino acid aminotransferase  47.75 
 
 		 370 aa  315  5e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.11259 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4282  branched-chain amino acid aminotransferase  46.41 
 
 		 364 aa  315  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342544  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5588  branched-chain amino acid aminotransferase  45.11 
 
 		 362 aa  315  8e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0289083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3139  branched-chain amino acid aminotransferase  48.05 
 
 		 370 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0047  branched-chain amino acid aminotransferase  44.13 
 
 		 361 aa  314  9.999999999999999e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0711  branched chain amino acid aminotransferase  43.75 
 
 		 361 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0778  branched-chain amino acid aminotransferase  44.35 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4854  branched-chain amino acid aminotransferase  48.56 
 
 		 370 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1393  Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase protein  43.75 
 
 		 367 aa  311  9e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  45.45 
 
 		 363 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229178  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3957  branched-chain amino acid aminotransferase  41.18 
 
 		 379 aa  310  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4288  branched-chain amino acid aminotransferase  44.51 
 
 		 365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1739  branched-chain amino acid aminotransferase  48.04 
 
 		 359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829629  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3370  branched-chain amino acid aminotransferase  45.86 
 
 		 368 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.142913 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3319  branched-chain amino acid aminotransferase  45.86 
 
 		 368 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3308  branched-chain amino acid aminotransferase  45.86 
 
 		 368 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2267  branched-chain amino acid aminotransferase  43.5 
 
 		 370 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097897 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0259  branched-chain amino acid aminotransferase  44.38 
 
 		 354 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.581012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3425  branched-chain amino acid aminotransferase  43.3 
 
 		 365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2529  branched chain amino acid aminotransferase  43.66 
 
 		 370 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00227274  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1240  branched-chain amino acid aminotransferase  41.95 
 
 		 365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2382  branched-chain amino acid aminotransferase  43.84 
 
 		 377 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4084  branched-chain amino acid aminotransferase  46.42 
 
 		 359 aa  302  5.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5661  branched-chain amino acid aminotransferase  43.39 
 
 		 365 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3725  branched-chain amino acid aminotransferase  43.39 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20757  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4643  branched-chain amino acid aminotransferase  43.39 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0586  branched-chain amino acid aminotransferase  42.69 
 
 		 375 aa  299  6e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1353  branched-chain amino acid aminotransferase  45.4 
 
 		 374 aa  298  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.393805  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1327  branched-chain amino acid aminotransferase  43.27 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1358  branched-chain amino acid aminotransferase  43.27 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0747  branched-chain amino acid aminotransferase  42.41 
 
 		 368 aa  297  2e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.031248  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6410  branched-chain amino acid aminotransferase  41.89 
 
 		 374 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.545027 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0858  branched-chain-amino-acid transaminase  41.55 
 
 		 389 aa  294  2e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6535  branched-chain amino acid aminotransferase  42.26 
 
 		 372 aa  293  4e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6122  branched-chain amino acid aminotransferase  41.72 
 
 		 354 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08600  branched chain amino acid aminotransferase  43.34 
 
 		 363 aa  289  5.0000000000000004e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.367777  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3428  branched-chain amino acid aminotransferase  40.54 
 
 		 353 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3509  branched-chain amino acid aminotransferase  40.54 
 
 		 353 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3577  branched-chain amino acid aminotransferase  40.24 
 
 		 353 aa  285  7e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18760  branched chain amino acid aminotransferase  44.61 
 
 		 363 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09890  branched chain amino acid aminotransferase  40.52 
 
 		 373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.03528 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1130  branched-chain amino acid aminotransferase  42.24 
 
 		 365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4266  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2487  branched-chain amino acid aminotransferase  43.31 
 
 		 366 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2742  branched-chain amino acid aminotransferase  43.31 
 
 		 366 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3303  branched-chain amino acid aminotransferase  42.94 
 
 		 355 aa  281  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0889  branched chain amino acid aminotransferase  43.03 
 
 		 355 aa  278  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10790  branched chain amino acid aminotransferase  43.97 
 
 		 374 aa  275  7e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1418  branched-chain amino acid aminotransferase  41.09 
 
 		 377 aa  274  1.0000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1098  branched-chain amino acid aminotransferase  41 
 
 		 356 aa  274  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0823676  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  41.49 
 
 		 350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2817  branched chain amino acid aminotransferase  38.07 
 
 		 358 aa  273  5.000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43697  predicted protein  43.47 
 
 		 356 aa  272  6e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.908451  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34985  predicted protein  42.99 
 
 		 371 aa  269  5e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.127685  normal  0.13999 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00980  hypothetical protein  43.82 
 
 		 437 aa  266  4e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84005  branched-chain amino acid transaminase  42.6 
 
 		 370 aa  265  7e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.352403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>