More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0227 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0227  acetylornithine deacetylase  100 
 
 		 382 aa  793    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  57.37 
 
 		 383 aa  475  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  55.84 
 
 		 389 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  55.84 
 
 		 387 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  55.84 
 
 		 387 aa  473  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  56.84 
 
 		 383 aa  472  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  54.21 
 
 		 381 aa  470  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  55.56 
 
 		 383 aa  464  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  55.56 
 
 		 383 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  55.56 
 
 		 383 aa  464  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  54.21 
 
 		 383 aa  464  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  55.56 
 
 		 383 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  55.56 
 
 		 383 aa  464  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  55.56 
 
 		 383 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  55.56 
 
 		 383 aa  464  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  55.56 
 
 		 383 aa  464  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  55.29 
 
 		 383 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  53.7 
 
 		 383 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  53.7 
 
 		 383 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  53.56 
 
 		 383 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  53.7 
 
 		 383 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  53.7 
 
 		 383 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0194  acetylornithine deacetylase  56.84 
 
 		 382 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3920  acetylornithine deacetylase  57.11 
 
 		 383 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  54.86 
 
 		 378 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  55.26 
 
 		 378 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  53.56 
 
 		 386 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  52.51 
 
 		 383 aa  434  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  52.51 
 
 		 383 aa  431  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  53.14 
 
 		 383 aa  430  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0328  acetylornithine deacetylase  53.87 
 
 		 383 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  48.42 
 
 		 391 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4277  acetylornithine deacetylase  52.51 
 
 		 383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00886468  normal  0.333205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  50.26 
 
 		 387 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  52.77 
 
 		 382 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  50.13 
 
 		 380 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  49.61 
 
 		 380 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  49.34 
 
 		 380 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2221  acetylornithine deacetylase  52.89 
 
 		 378 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0456385  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2755  acetylornithine deacetylase  52.89 
 
 		 378 aa  396  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  49.87 
 
 		 380 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  48.56 
 
 		 388 aa  391  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  48.4 
 
 		 381 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  49.61 
 
 		 395 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  48.56 
 
 		 382 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  48.02 
 
 		 386 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  48.95 
 
 		 388 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  49.34 
 
 		 382 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  47.51 
 
 		 384 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04910  acetylornithine deacetylase  48.29 
 
 		 385 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  46.72 
 
 		 383 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  46.98 
 
 		 388 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  46.81 
 
 		 387 aa  362  4e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  43.96 
 
 		 389 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1225  peptidase dimerization domain protein  43.37 
 
 		 261 aa  215  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.39 
 
 		 388 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  33.88 
 
 		 412 aa  199  6e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  32.22 
 
 		 397 aa  196  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  32.17 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  31.93 
 
 		 374 aa  193  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  35.45 
 
 		 375 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  32.17 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  32.64 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  30.2 
 
 		 397 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  32.04 
 
 		 386 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  29.95 
 
 		 397 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.58 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  30 
 
 		 406 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  30.59 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  32.11 
 
 		 374 aa  187  4e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  33.25 
 
 		 384 aa  186  6e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  30.97 
 
 		 403 aa  186  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  29.53 
 
 		 406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  31.83 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  29.95 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  29.67 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  29.67 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  30.85 
 
 		 386 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  31.59 
 
 		 386 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  29.53 
 
 		 406 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  30.05 
 
 		 406 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.94 
 
 		 398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  30.85 
 
 		 391 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  33.93 
 
 		 384 aa  182  6e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  32.18 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  29.79 
 
 		 406 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  29.79 
 
 		 406 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  30.36 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  29.79 
 
 		 406 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  31.69 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  29.38 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  29.38 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  29.38 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  29.38 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  31.9 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  29.38 
 
 		 586 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  33.94 
 
 		 386 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  29.49 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  32.81 
 
 		 380 aa  180  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  30.1 
 
 		 404 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>