142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3339 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3339  putative Zn-dependent aminopeptidase  100 
 
 
526 aa  1083    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3947  aminopeptidase precursor  31.38 
 
 
666 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4942  putative aminopeptidase precursor  30.7 
 
 
689 aa  220  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1430  aminopeptidase, putative  27.94 
 
 
811 aa  216  5.9999999999999996e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0410174  hitchhiker  0.0000000588353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6044  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.61 
 
 
649 aa  216  7e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.334803  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1191  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.44 
 
 
640 aa  214  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.820594  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2032  Aminopeptidase N-like protein  29.31 
 
 
1026 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04033  putative Zn-dependent aminopeptidase  29.14 
 
 
821 aa  211  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0154987  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0395  peptidase  30.96 
 
 
638 aa  211  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0411  putative aminopeptidase  29.96 
 
 
792 aa  209  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03240  Zn-dependent aminopeptidase  29.46 
 
 
603 aa  208  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.0027723  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4270  putative Zn-dependent aminopeptidase  28.88 
 
 
816 aa  206  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1880  putative aminopeptidase  31.02 
 
 
775 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2696  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.96 
 
 
619 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.133709  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4234  putative aminopeptidase  29.36 
 
 
793 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000700491  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0409  putative Zn-dependent aminopeptidase  27.93 
 
 
815 aa  199  7e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0694511  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3951  Aminopeptidase N-like protein  30.12 
 
 
900 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.823523  normal  0.346171 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1781  putative Zn-dependent aminopeptidase  29.05 
 
 
838 aa  197  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488569  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3437  aminopeptidase N-like protein  30.46 
 
 
756 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296035  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1241  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.77 
 
 
620 aa  189  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.778581  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2099  putative Zn-dependent aminopeptidase  27.47 
 
 
818 aa  189  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0836381  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3469  putative aminopeptidase  30.61 
 
 
778 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0337605 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07610  Zn-dependent aminopeptidase  29.28 
 
 
770 aa  187  4e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5083  putative aminopeptidase  29.14 
 
 
801 aa  186  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.34 
 
 
480 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1773  aminopeptidase N-like protein  30.15 
 
 
745 aa  184  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3700  putative aminopeptidase precursor  29.09 
 
 
655 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0655  putative aminopeptidase precursor  29.48 
 
 
655 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5082  Zn-dependent aminopeptidase  27.62 
 
 
792 aa  179  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.546478 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0685  putative aminopeptidase precursor  29.29 
 
 
655 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0677  putative aminopeptidase precursor  29.29 
 
 
655 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.796434  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02197  peptidase  27.99 
 
 
668 aa  176  8e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6925  Aminopeptidase N-like protein  27.89 
 
 
628 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1442  aminopeptidase N  30.42 
 
 
1079 aa  170  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.956828  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2017  peptidase  29.08 
 
 
732 aa  164  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1889  hypothetical protein  26.86 
 
 
610 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1830  peptidase  26.63 
 
 
663 aa  143  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.932627  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3347  hypothetical protein  25.9 
 
 
631 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1084  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.21 
 
 
482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.799271  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4868  aminopeptidase N-like protein  26.08 
 
 
623 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0331081  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2423  aminopeptidase N  21.82 
 
 
489 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.04 
 
 
506 aa  99.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3101  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.47 
 
 
492 aa  97.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0417  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.18 
 
 
446 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  19.32 
 
 
504 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.73 
 
 
559 aa  85.1  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1564  hypothetical protein  22.2 
 
 
922 aa  84.7  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0116827  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0293  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.76 
 
 
504 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.03684  normal  0.0231195 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.88 
 
 
768 aa  78.6  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0590  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.69 
 
 
518 aa  73.9  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0535796  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05812  Leukotriene A-4 hydrolase (EC 3.3.2.6)(Leukotriene A(4) hydrolase)(LTA-4 hydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0W8]  32.68 
 
 
618 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5527  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.44 
 
 
517 aa  70.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2314  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.57 
 
 
652 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00696087  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3470  neutral zinc metallopeptidase M1 family protein  29.38 
 
 
629 aa  67.8  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10018  Aminopeptidase N  23.27 
 
 
937 aa  66.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2703  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.77 
 
 
647 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000156716  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2381  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.35 
 
 
702 aa  65.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2589  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.19 
 
 
647 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000915199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2628  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.88 
 
 
647 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000178054  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1757  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.88 
 
 
647 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000341023  normal  0.0233957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1551  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.18 
 
 
615 aa  65.1  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.043081  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0741  leukotriene A4 hydrolase  28.49 
 
 
671 aa  64.3  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697982  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2267  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.19 
 
 
642 aa  63.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.283529  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0830  aminopeptidase N  28.49 
 
 
647 aa  63.5  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387372  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03140  putative cold-active aminopeptidase; secreted using a signal peptide  29.71 
 
 
643 aa  63.9  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409297  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1997  M1 family peptidase  26.97 
 
 
628 aa  63.5  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2339  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.97 
 
 
642 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239765  normal  0.0830864 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3111  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.33 
 
 
633 aa  62.4  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2457  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.37 
 
 
642 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.982771  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4511  hypothetical protein  19.44 
 
 
915 aa  61.6  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.813242  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.21 
 
 
823 aa  61.2  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2445  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.21 
 
 
617 aa  61.2  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191901  normal  0.796062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5824  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.71 
 
 
551 aa  60.1  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804556 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3459  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.74 
 
 
642 aa  57.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3592  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.55 
 
 
648 aa  57.4  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04276  aminopeptidase  25.43 
 
 
670 aa  55.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3299  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.14 
 
 
597 aa  53.9  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358084  decreased coverage  0.0000000385045 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76777  leukotriene A-4 hydrolase (LTA-4 hydrolase) (Leukotriene A(4) hydrolase)  24.43 
 
 
626 aa  53.9  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.937224  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0387  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.53 
 
 
516 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.694523  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4528  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.75 
 
 
457 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.567205  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1078  M1 family peptidase  23.7 
 
 
598 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000177882  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2742  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.45 
 
 
606 aa  52.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.280641  hitchhiker  0.000071737 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1374  aminopeptidase N  25.19 
 
 
892 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.58 
 
 
835 aa  52.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13602  predicted protein  29.03 
 
 
620 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0213622  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04600  leukotriene-A4 hydrolase, putative  31.37 
 
 
479 aa  52  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0099794  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1698  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.03 
 
 
403 aa  51.6  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0606871  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2965  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.27 
 
 
597 aa  51.2  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0642  aminopeptidase N  24.76 
 
 
884 aa  50.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411291  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0194  aminopeptidase N  24.05 
 
 
888 aa  50.4  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1238  aminopeptidase N  22.64 
 
 
871 aa  50.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.22962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  24.61 
 
 
866 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2167  aminopeptidase N  22.4 
 
 
877 aa  50.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268834 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  22.55 
 
 
865 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2876  response regulator receiver protein  25 
 
 
604 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000228252  hitchhiker  0.000169705 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2067  aminopeptidase N  21.92 
 
 
880 aa  49.3  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149086  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82220  Probable leukotriene A-4 hydrolase (LTA-4 hydrolase) (Leukotriene A(4) hydrolase)  25.98 
 
 
635 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.126377 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.77 
 
 
823 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3448  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.31 
 
 
595 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00063727 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1561  M1 family peptidase  24.71 
 
 
598 aa  48.9  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>