More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0642 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_3081  aminopeptidase N  47.49 
 
 		 851 aa  715    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0616  aminopeptidase N  58.96 
 
 		 883 aa  1053    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00936  aminopeptidase N  45 
 
 		 870 aa  749    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00647733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2711  aminopeptidase N  45 
 
 		 870 aa  749    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100798  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1223  aminopeptidase N  48.36 
 
 		 851 aa  781    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.336507 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0304  aminopeptidase N  47.33 
 
 		 877 aa  784    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2017  aminopeptidase N  46.52 
 
 		 885 aa  788    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.981665  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0774  aminopeptidase N  47.2 
 
 		 883 aa  789    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2125  aminopeptidase N  47.26 
 
 		 905 aa  772    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1844  aminopeptidase N  48.07 
 
 		 903 aa  752    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2808  aminopeptidase N  42.52 
 
 		 872 aa  715    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26022  predicted protein  42.53 
 
 		 924 aa  684    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.812469 
 
 
-
 
NC_004310  BR0617  aminopeptidase N  58.84 
 
 		 883 aa  1053    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4749  aminopeptidase N  56.29 
 
 		 876 aa  975    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2600  aminopeptidase N  43.67 
 
 		 849 aa  716    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3788  aminopeptidase N  46.64 
 
 		 888 aa  790    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345358  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0466  aminopeptidase N  46.67 
 
 		 900 aa  739    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126915  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2556  aminopeptidase N  45.8 
 
 		 871 aa  755    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0655093  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2855  aminopeptidase N  44.58 
 
 		 865 aa  744    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2662  aminopeptidase N  58.28 
 
 		 883 aa  1044    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2724  aminopeptidase N  44.24 
 
 		 865 aa  738    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1451  aminopeptidase N  43.98 
 
 		 870 aa  741    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1690  aminopeptidase N  46.21 
 
 		 888 aa  776    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.325147 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2559  aminopeptidase N  43.04 
 
 		 849 aa  704    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.841322  normal  0.125353 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3676  aminopeptidase N  47.18 
 
 		 868 aa  769    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2922  aminopeptidase N  46.78 
 
 		 900 aa  741    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0957  aminopeptidase N  50.9 
 
 		 878 aa  860    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2443  aminopeptidase N  47.79 
 
 		 899 aa  791    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2754  aminopeptidase N  45.72 
 
 		 865 aa  716    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0899  aminopeptidase N  46.61 
 
 		 925 aa  732    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570947  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0642  aminopeptidase N  100 
 
 		 884 aa  1822    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411291  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3028  aminopeptidase N  46.78 
 
 		 957 aa  741    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1314  aminopeptidase N  46.52 
 
 		 883 aa  794    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.542169  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2200  aminopeptidase N  45.86 
 
 		 885 aa  787    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.94331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1982  aminopeptidase N  48.18 
 
 		 851 aa  721    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1649  aminopeptidase N  44.01 
 
 		 888 aa  739    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00465635  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4126  aminopeptidase N  47.23 
 
 		 897 aa  749    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352628  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1936  aminopeptidase N  44.42 
 
 		 853 aa  712    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.715788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1734  aminopeptidase N  45.52 
 
 		 871 aa  757    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.357602  normal  0.222702 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1485  aminopeptidase N  42.76 
 
 		 884 aa  719    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.388808  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0620  aminopeptidase N  40.71 
 
 		 852 aa  659    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1041  aminopeptidase N  45 
 
 		 870 aa  749    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.230058  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2167  aminopeptidase N  45.81 
 
 		 877 aa  794    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268834 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1608  aminopeptidase N  46.88 
 
 		 919 aa  721    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535966  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2067  aminopeptidase N  46.97 
 
 		 880 aa  801    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149086  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0668  aminopeptidase N  47.87 
 
 		 869 aa  788    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02344  aminopeptidase N  43.86 
 
 		 868 aa  736    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0120  aminopeptidase N  46 
 
 		 903 aa  742    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269734  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3270  aminopeptidase N  46.38 
 
 		 871 aa  735    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1872  aminopeptidase N  45.81 
 
 		 856 aa  715    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.802085  normal  0.0348851 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2703  aminopeptidase N  45.39 
 
 		 904 aa  727    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2774  aminopeptidase N  44.98 
 
 		 898 aa  707    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1737  aminopeptidase N  45.92 
 
 		 890 aa  788    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1238  aminopeptidase N  46.58 
 
 		 871 aa  739    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1587  aminopeptidase N  45.97 
 
 		 906 aa  740    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0923  aminopeptidase N  46.67 
 
 		 898 aa  759    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1723  aminopeptidase N  43.53 
 
 		 852 aa  714    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.148717  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2759  aminopeptidase N  46.2 
 
 		 900 aa  742    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2482  aminopeptidase N  42.74 
 
 		 855 aa  699    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0279976  hitchhiker  0.00729308 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2521  aminopeptidase N  46.61 
 
 		 879 aa  786    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0876  aminopeptidase N  48.18 
 
 		 897 aa  783    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2939  aminopeptidase N  46.86 
 
 		 885 aa  791    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0383897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0706  aminopeptidase N  46.59 
 
 		 854 aa  752    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.281728 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0475  aminopeptidase N  46.97 
 
 		 864 aa  741    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.392595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0536  aminopeptidase N  47.23 
 
 		 897 aa  744    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0439  aminopeptidase N  51.59 
 
 		 875 aa  941    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.956932  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1741  aminopeptidase N  44.13 
 
 		 901 aa  761    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00168597  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1996  aminopeptidase N  44.13 
 
 		 874 aa  723    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0466032  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0906  aminopeptidase N  60.8 
 
 		 881 aa  1092    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0161  aminopeptidase N  46.67 
 
 		 900 aa  739    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0884  aminopeptidase N  43.76 
 
 		 869 aa  730    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0859653  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2104  aminopeptidase N  48.34 
 
 		 887 aa  744    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0562697  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1674  aminopeptidase N  44.06 
 
 		 849 aa  717    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0300975  normal  0.663884 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1749  aminopeptidase N  43.61 
 
 		 849 aa  710    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0219335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1592  aminopeptidase N  46.66 
 
 		 881 aa  731    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2227  aminopeptidase N  42.99 
 
 		 853 aa  687    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.396627  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3725  aminopeptidase N  46.41 
 
 		 885 aa  784    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0878  aminopeptidase N  47.23 
 
 		 897 aa  744    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653112  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24270  aminopeptidase N  46.34 
 
 		 885 aa  781    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.626767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2983  aminopeptidase N  46.78 
 
 		 900 aa  740    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0692  aminopeptidase N  48.18 
 
 		 882 aa  727    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.625099  normal  0.73925 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2446  aminopeptidase N  43.04 
 
 		 849 aa  705    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1033  aminopeptidase N  44.77 
 
 		 870 aa  748    Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00218696  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36617  predicted protein  45.49 
 
 		 884 aa  745    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000615494  hitchhiker  0.0024222 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0986  aminopeptidase N  46.67 
 
 		 900 aa  739    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636774  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19807  predicted protein  44.24 
 
 		 869 aa  708    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137348  normal  0.504611 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1015  aminopeptidase N  47.23 
 
 		 897 aa  744    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2439  aminopeptidase N  43.15 
 
 		 849 aa  707    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.385207  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1919  aminopeptidase N  45.2 
 
 		 885 aa  731    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.280956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1779  aminopeptidase N  43.9 
 
 		 849 aa  712    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0345573 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4053  aminopeptidase N  47.95 
 
 		 847 aa  751    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.339563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1803  aminopeptidase N  46.34 
 
 		 853 aa  753    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0680327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1068  aminopeptidase N  45.73 
 
 		 915 aa  744    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2201  aminopeptidase N  43.69 
 
 		 849 aa  724    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1150  aminopeptidase N  46.07 
 
 		 926 aa  759    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1586  aminopeptidase N  43.15 
 
 		 852 aa  688    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2055  aminopeptidase N  46.12 
 
 		 885 aa  776    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194007  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1102  aminopeptidase N  43.62 
 
 		 868 aa  730    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2614  aminopeptidase N  46.67 
 
 		 900 aa  739    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2344  aminopeptidase N  41.84 
 
 		 880 aa  675    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>