209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2627 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
194 aa  396  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3623  bifunctional deaminase-reductase domain protein  52.63 
 
 
192 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  38.78 
 
 
218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  40.58 
 
 
228 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  37.44 
 
 
203 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  39.25 
 
 
221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  36 
 
 
205 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  37.06 
 
 
198 aa  122  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  37.06 
 
 
219 aa  121  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.86 
 
 
212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.03 
 
 
221 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  36.04 
 
 
199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.05 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.22 
 
 
219 aa  110  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  34.69 
 
 
208 aa  110  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.46 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.03 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  34.5 
 
 
200 aa  108  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.82 
 
 
201 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.14 
 
 
217 aa  105  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.61 
 
 
201 aa  102  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.89 
 
 
204 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.29 
 
 
181 aa  100  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  31.18 
 
 
215 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  31.82 
 
 
221 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  32.42 
 
 
204 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.23 
 
 
210 aa  98.2  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 
221 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.63 
 
 
201 aa  98.2  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  34.62 
 
 
178 aa  97.8  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 
221 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  35.05 
 
 
181 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 
204 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  32.99 
 
 
181 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.16 
 
 
178 aa  94.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.97 
 
 
180 aa  92.8  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.79 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.05 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  34.24 
 
 
178 aa  92  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.2 
 
 
192 aa  91.7  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  37.2 
 
 
179 aa  91.7  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  32.24 
 
 
183 aa  90.9  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.45 
 
 
186 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.8 
 
 
180 aa  89  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.77 
 
 
200 aa  88.6  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.8 
 
 
209 aa  88.2  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.12 
 
 
182 aa  87.8  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.41 
 
 
196 aa  87  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  30.81 
 
 
183 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  32.62 
 
 
213 aa  86.3  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  29.51 
 
 
180 aa  84.7  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  30.57 
 
 
208 aa  84.3  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.88 
 
 
188 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.38 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  31.87 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.45 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.05 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.26 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.84 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  32.07 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  31.32 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.85 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  29.29 
 
 
205 aa  79  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.32 
 
 
224 aa  79  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.27 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.31 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.81 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.52 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  32.29 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.35 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  28.02 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  26.84 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  31.22 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.26 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  29.33 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.41 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  31.87 
 
 
183 aa  72  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.54 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  30.05 
 
 
187 aa  72  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.03 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.62 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.78 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  29.27 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  29.28 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.55 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.79 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.66 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  28.66 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.45 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0902  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.28 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.74 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.28 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.01 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  28.57 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.03 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  27.92 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.77 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.26 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.5 
 
 
192 aa  62.8  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>