More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3346 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3346  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 
357 aa  716    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3032  alcohol dehydrogenase  85.15 
 
 
357 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2536  zinc-binding alcohol dehydrogenase  82.91 
 
 
357 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.563542  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0669  alcohol dehydrogenase  79.21 
 
 
374 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.704397  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0203  zinc-binding alcohol dehydrogenase  77.31 
 
 
357 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0325811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3514  alcohol dehydrogenase  76 
 
 
373 aa  548  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0265  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  75.79 
 
 
371 aa  541  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.901967  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5645  alcohol dehydrogenase  73.39 
 
 
357 aa  541  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.419975 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2064  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  73.95 
 
 
357 aa  543  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07420  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  74.23 
 
 
357 aa  535  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1356  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  70.52 
 
 
366 aa  511  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3188  alcohol dehydrogenase  70.64 
 
 
366 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3852  alcohol dehydrogenase  69.7 
 
 
365 aa  507  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0967  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  69.15 
 
 
366 aa  503  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.635093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1049  alcohol dehydrogenase  69.15 
 
 
366 aa  503  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.050805 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2137  alcohol dehydrogenase  69.75 
 
 
351 aa  501  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0423941 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2008  alcohol dehydrogenase protein  66.48 
 
 
364 aa  497  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3465  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  69.15 
 
 
366 aa  496  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.901244  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.58 
 
 
354 aa  342  5.999999999999999e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3460  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.62 
 
 
354 aa  330  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00073426  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2240  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.94 
 
 
355 aa  302  5.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0360217 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4352  alcohol dehydrogenase  43.38 
 
 
354 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0548  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.48 
 
 
350 aa  275  8e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0435  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.1 
 
 
351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.692768  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.07 
 
 
349 aa  267  2e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.228893  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  39.55 
 
 
352 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.38 
 
 
346 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0322  alcohol dehydrogenase  39.61 
 
 
347 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.65143  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1091  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.7 
 
 
342 aa  228  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3962  alcohol dehydrogenase  40.5 
 
 
351 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5816  alcohol dehydrogenase  39.24 
 
 
346 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.136095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0924  putative zinc-dependent alcohol dehydrogenase (oxidoreductase)  39.89 
 
 
345 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175832  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4290  alcohol dehydrogenase  40.23 
 
 
346 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5892  alcohol dehydrogenase  39.65 
 
 
346 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.032769  normal  0.939128 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2770  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.82 
 
 
356 aa  223  6e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3075  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.78 
 
 
347 aa  222  7e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.1 
 
 
346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.539752  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2366  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.98 
 
 
347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.0010665  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3657  alcohol dehydrogenase  39.13 
 
 
347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal  0.2926 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.66 
 
 
370 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3822  alcohol dehydrogenase  39.65 
 
 
346 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2090  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.89 
 
 
351 aa  219  6e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000167964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1860  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.2 
 
 
346 aa  219  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5564  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.36 
 
 
346 aa  219  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175264  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1399  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.18 
 
 
352 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1160  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.42 
 
 
346 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  39.42 
 
 
346 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0709  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.42 
 
 
346 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470076  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2432  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.42 
 
 
346 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1718  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.42 
 
 
346 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0753  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.42 
 
 
346 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574599  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.1 
 
 
345 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2034  hypothetical protein  37.36 
 
 
346 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.1 
 
 
355 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1565  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.84 
 
 
349 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.965017  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1637  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.83 
 
 
351 aa  216  4e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000634163  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0194  zinc-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  38.78 
 
 
345 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0653  alcohol dehydrogenase  35.98 
 
 
352 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.37 
 
 
345 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0642635 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1221  alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 
343 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1334  alcohol dehydrogenase  37.9 
 
 
344 aa  209  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0764  hypothetical protein  37.13 
 
 
357 aa  209  8e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0197136 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1415  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.11 
 
 
352 aa  208  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.275014  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2344  alcohol dehydrogenase (NADP+)  35.69 
 
 
352 aa  206  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100089  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4901  alcohol dehydrogenase  38.1 
 
 
360 aa  206  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1378  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.12 
 
 
352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1073  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.13 
 
 
351 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1089  alcohol dehydrogenase  36.13 
 
 
351 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1713  alcohol dehydrogenase  39.22 
 
 
343 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1380  alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
348 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378076  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.19 
 
 
385 aa  196  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0010  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.96 
 
 
346 aa  196  7e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.133832  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
384 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0219  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.95 
 
 
350 aa  193  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.84 
 
 
389 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1228  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.5 
 
 
352 aa  192  5e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.966969 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4997  alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 
348 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1112  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.78 
 
 
351 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.257407  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2112  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.49 
 
 
350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0323338  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.01 
 
 
385 aa  189  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3239  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  36.41 
 
 
356 aa  186  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1246  zinc-type alcohol dehydrogenase  31.81 
 
 
385 aa  184  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.939827  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2283  alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 
422 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243543  hitchhiker  0.000541864 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.92 
 
 
405 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2657  alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
388 aa  179  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3120  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.36 
 
 
410 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0139  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.1 
 
 
401 aa  179  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.65 
 
 
388 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1100  alcohol dehydrogenase  39.16 
 
 
299 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0318515  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.5 
 
 
382 aa  177  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.25 
 
 
382 aa  177  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  hitchhiker  0.000850612 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4893  alcohol dehydrogenase  35.2 
 
 
330 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709624  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.66 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1174  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.86 
 
 
410 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0592  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.34 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.57 
 
 
389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4212  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.96 
 
 
376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000750849  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.81 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.72 
 
 
384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.9 
 
 
392 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>