121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3033 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  100 
 
 		 320 aa  667    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  65.89 
 
 		 312 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  65.36 
 
 		 312 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  47.13 
 
 		 323 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  44.48 
 
 		 335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  44.16 
 
 		 344 aa  265  8e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  44.81 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  44.22 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  48.41 
 
 		 321 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  45.97 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  42.95 
 
 		 332 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  42.95 
 
 		 332 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  42.62 
 
 		 332 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  41.95 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  42.95 
 
 		 434 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  42.27 
 
 		 319 aa  219  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  39.86 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  41.7 
 
 		 326 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  41.7 
 
 		 326 aa  205  9e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  41.2 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  40.97 
 
 		 312 aa  203  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  40.51 
 
 		 301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  39.93 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  39.23 
 
 		 299 aa  198  7.999999999999999e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  39.06 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  41.26 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  38.54 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  40.51 
 
 		 1077 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  39.19 
 
 		 317 aa  195  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  39.19 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  37.5 
 
 		 294 aa  192  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  39.2 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  38.08 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  38.89 
 
 		 285 aa  189  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  40.33 
 
 		 306 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  39.8 
 
 		 304 aa  188  9e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  36.96 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  40 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  38.24 
 
 		 986 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  40.06 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  37.91 
 
 		 338 aa  186  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  38.13 
 
 		 319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  38.66 
 
 		 1495 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  38.51 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  38.26 
 
 		 320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  38.26 
 
 		 320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  38.44 
 
 		 316 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  38.33 
 
 		 321 aa  180  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  38.41 
 
 		 1448 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  38.41 
 
 		 1448 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  35.24 
 
 		 295 aa  179  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  38.71 
 
 		 306 aa  178  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  37.75 
 
 		 1580 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  38.36 
 
 		 410 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  35.67 
 
 		 288 aa  177  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  35.24 
 
 		 310 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  37.75 
 
 		 313 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  36.96 
 
 		 322 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  38.46 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  37.75 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  37.83 
 
 		 362 aa  173  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  35.51 
 
 		 319 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  34.19 
 
 		 297 aa  172  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  35.74 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  36.22 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  36.22 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  36.59 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  35.48 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  36.54 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  34.91 
 
 		 297 aa  165  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  37.01 
 
 		 308 aa  165  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  34.62 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  35.39 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  33.44 
 
 		 299 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  33.14 
 
 		 384 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  34.55 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  34.8 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6843  domain of unknown function DUF1738  31.53 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal  0.17936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  39.27 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2363  domain of unknown function DUF1738  34.33 
 
 		 275 aa  152  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  33.22 
 
 		 660 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0034  putative DNA replication primase  33.74 
 
 		 682 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000123462  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  36.19 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  33.88 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  34.44 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  34.11 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5500  domain of unknown function DUF1738  32.12 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348911 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0037  hypothetical protein  36.49 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  37.55 
 
 		 248 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  32.01 
 
 		 300 aa  139  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  36.33 
 
 		 247 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  31.4 
 
 		 1716 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  31.79 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4983  hypothetical protein  34.76 
 
 		 241 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  30.26 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2005  hypothetical protein  37.85 
 
 		 258 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.146058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  30.92 
 
 		 310 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2408  domain of unknown function DUF1738  31.33 
 
 		 313 aa  125  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038447  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3267  hypothetical protein  34.7 
 
 		 341 aa  122  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4227  antirestriction protein  44.12 
 
 		 184 aa  122  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0722776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>