More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2762 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2762  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 
373 aa  761    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3773  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  48.24 
 
 
394 aa  346  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719874  normal  0.310272 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1606  sensor histidine kinase  48.24 
 
 
403 aa  341  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  46.87 
 
 
396 aa  330  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.01 
 
 
405 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364137  hitchhiker  0.00137418 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3583  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 
397 aa  311  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5176  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 
570 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03779  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  41.03 
 
 
410 aa  300  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.601764  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2321  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.05 
 
 
396 aa  296  4e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.988363 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03623  sensor histidine kinase  36.31 
 
 
414 aa  223  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2158  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
414 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5747  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
417 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00131351  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0791  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
415 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  59.29 
 
 
684 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3622  PAS sensor protein  58.57 
 
 
684 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2174  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
413 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0619  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 
379 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0923552  normal  0.109315 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4439  sensor histidine kinase  36.55 
 
 
376 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4542  GAF domain protein  49.28 
 
 
166 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592539  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4896  sensor histidine kinase  32.25 
 
 
376 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6441  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 
375 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.152019 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0278  histidine kinase  39.55 
 
 
405 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4219  hypothetical protein  49.28 
 
 
166 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0267  histidine kinase  39.55 
 
 
405 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2993  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
393 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0256  histidine kinase  38.64 
 
 
405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1538  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
394 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461461  normal  0.397408 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
621 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0030  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
460 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292632  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2988  histidine kinase  38.64 
 
 
380 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.539821  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3993  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
390 aa  142  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.967169  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3968  sensor histidine kinase  38.53 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838601  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
557 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 
734 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.656612  hitchhiker  0.0000890263 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0278  histidine kinase  37.5 
 
 
471 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.182643 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
618 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
595 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1918  sensor histidine kinase  37.22 
 
 
377 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
392 aa  136  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287383  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2279  histidine kinase  37.84 
 
 
447 aa  135  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2123  sensor histidine kinase  38.05 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3228  histidine kinase  38.39 
 
 
387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0650  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
382 aa  134  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0579  histidine kinase  35 
 
 
375 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1605  sensory box histidine kinase  34.31 
 
 
391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.747269  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0629  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.67365  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3149  histidine kinase  35.56 
 
 
383 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.458506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0975  putative bacteriophytochrome  35.06 
 
 
728 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3183  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
442 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319198  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3912  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 
912 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237166  normal  0.236216 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0832  histidine kinase  28.85 
 
 
383 aa  124  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.636786  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10700  putative bacteriophytochrome  34.82 
 
 
728 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3774  PAS  33.05 
 
 
395 aa  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.195933  normal  0.315596 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5936  histidine kinase  34.23 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3249  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 
944 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894868  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4368  histidine kinase  31.65 
 
 
373 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1396  two-component system, sensor kinase protein KdpD  31.72 
 
 
993 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201035  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1024  two-component system, sensor kinase protein KdpD  32.41 
 
 
1035 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1253  sensor histidine kinase KdpD  31.72 
 
 
993 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1245  sensor histidine kinase KdpD  31.72 
 
 
993 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.561584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1087  sensor protein KdpD  31.72 
 
 
954 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0780  sensor histidine kinase KdpD  31.72 
 
 
954 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.795165  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1311  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
944 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.162113 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4726  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
368 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.745377  normal  0.599724 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2290  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
951 aa  117  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.014043  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5921  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
904 aa  115  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4877  PAS sensor protein  40.69 
 
 
643 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4207  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5362  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.34 
 
 
643 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0041  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
967 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.538382  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6438  histidine kinase  33.78 
 
 
373 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5387  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0971839 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1473  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
1084 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
815 aa  113  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1000  histidine kinase  29.55 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.146298  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
590 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2123  histidine kinase  31.44 
 
 
373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2503  two-component regulatory protein sensor kinase  32.97 
 
 
906 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5612  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31 
 
 
947 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162151  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2201  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
945 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394396  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2054  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
949 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414922  normal  0.736885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
387 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1997  histidine kinase  31.44 
 
 
371 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.337155  normal  0.0103218 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2323  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
945 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.6 
 
 
816 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6083  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
360 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5418  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.6 
 
 
774 aa  107  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2815  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 
412 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2387  histidine kinase  31.96 
 
 
400 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2355  hypothetical protein  37.59 
 
 
168 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0467445  normal  0.190321 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  32.91 
 
 
1003 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3731  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
411 aa  106  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1908  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
487 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218614  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
1516 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 
844 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10590  sensory histidine protein kinase  30.35 
 
 
488 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.36 
 
 
1965 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 
844 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2230  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 
707 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129446  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>