More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3669 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3669  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 
349 aa  709    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.555961  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3520  transcriptional regulator, LacI family  97.13 
 
 
349 aa  667    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0717  transcriptional regulator, LacI family  79.82 
 
 
344 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0665  transcriptional regulator, LacI family  80.41 
 
 
343 aa  552  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0509948  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5764  transcriptional regulator LacI family  41.69 
 
 
337 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.73775  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5365  transcriptional regulator, LacI family  38.94 
 
 
345 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000864241  normal  0.850622 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5085  transcriptional regulator, LacI family  39.53 
 
 
359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.127627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1883  transcriptional regulator, LacI family  36.92 
 
 
350 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.275447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1697  transcriptional regulator, LacI family  36.34 
 
 
351 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4336  transcriptional regulator, LacI family  32.36 
 
 
339 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563264  hitchhiker  0.000141472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2354  transcriptional regulator, LacI family  32.28 
 
 
356 aa  146  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3579  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.25 
 
 
344 aa  145  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4007  transcriptional regulator, LacI family  32.48 
 
 
343 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2628  transcriptional regulator, LacI family  31.71 
 
 
356 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03519  putative transcriptional regulator  30.23 
 
 
364 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03470  hypothetical protein  30.23 
 
 
356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3362  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  31.12 
 
 
360 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0979  LacI family transcription regulator  31.12 
 
 
360 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0927  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  31.12 
 
 
360 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  34.54 
 
 
338 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1641  transcriptional regulator, LacI family  32.47 
 
 
357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.236948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1610  transcriptional regulator, LacI family  30.23 
 
 
356 aa  133  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.42043  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1314  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.45 
 
 
357 aa  133  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.499254  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  31.25 
 
 
339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  29.51 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3600  LacI family transcription regulator  29.65 
 
 
360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0280148  normal  0.188315 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  31.69 
 
 
352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.94 
 
 
328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  28.77 
 
 
334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  27.51 
 
 
330 aa  127  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  27.51 
 
 
336 aa  125  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  27.06 
 
 
347 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  32.46 
 
 
347 aa  124  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1965  LacI family transcription regulator  30.88 
 
 
338 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1855  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  30.88 
 
 
338 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  27.25 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  28.26 
 
 
336 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  29.87 
 
 
333 aa  119  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  26.78 
 
 
334 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  30.2 
 
 
344 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2353  LacI family transcription regulator  28.03 
 
 
330 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000399478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  32.1 
 
 
342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  30 
 
 
334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.39 
 
 
341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  30.03 
 
 
340 aa  116  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0695  transcriptional regulator, LacI family  30.79 
 
 
330 aa  116  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0821691  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  29.25 
 
 
341 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.07 
 
 
352 aa  115  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  27.36 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0764  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.5 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.36 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0971  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.14 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002664  LacI-family regulatory protein  28.97 
 
 
341 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1286  putative DNA-binding sucrose operon transcriptional repressor transcription regulator protein  30.94 
 
 
344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.597152 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 
386 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.97 
 
 
341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.39 
 
 
341 aa  113  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.39 
 
 
341 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.39 
 
 
341 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.83 
 
 
330 aa  112  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1540  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.74 
 
 
341 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000065632  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1744  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.74 
 
 
341 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000285436  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1563  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.74 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00208837  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.57 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  29.43 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  28.98 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1526  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.74 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580264  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1913  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.74 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000592501  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  28.73 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1220  transcriptional regulator, LacI family  28.88 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.485348 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.72 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  29.65 
 
 
339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  26.65 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  28.62 
 
 
336 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1789  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.74 
 
 
341 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0286691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.02 
 
 
341 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 
340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3843  transcriptional regulator  28.97 
 
 
340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00298813  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  27.35 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  26.78 
 
 
336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  26.15 
 
 
333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  27.99 
 
 
333 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  31.5 
 
 
334 aa  110  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  28.74 
 
 
341 aa  109  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  28.74 
 
 
341 aa  109  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  28.74 
 
 
341 aa  109  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.74 
 
 
341 aa  109  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0805  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.86 
 
 
364 aa  109  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.74 
 
 
341 aa  109  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.74 
 
 
341 aa  109  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.74 
 
 
341 aa  109  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.74 
 
 
341 aa  109  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  28.66 
 
 
340 aa  109  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0466  transcriptional regulator, LacI family  27.84 
 
 
347 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.41 
 
 
341 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  29.6 
 
 
331 aa  109  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.99 
 
 
337 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0347  transcriptional regulator, LacI family  29.88 
 
 
347 aa  109  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2507  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  30.17 
 
 
338 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.445797  normal  0.20531 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  30.23 
 
 
368 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>